항체 문헌 및 데이터베이스 검색
질문에서 인용 가능한 근거로 이어지며, 모든 인용이 확인됩니다.
쓰기 전에 확인하기
이 세션에서 가져오지 않은 식별자는 절대 기록되지 않습니다. 이는 PMID, DOI, accession, PDB ID, 클론명, 카탈로그 번호 및 임상 시험 ID에도 동일하게 적용됩니다.
규칙은 순서대로 다음과 같습니다:
- 기억하지 말고 검색하세요. 항체 및 면역학 인용은 이 분야에서 그럴듯하게 잘못 생성하기 가장 쉬운 것입니다: 존재하지 않는 논문에 그럴듯한 저자, 저널, 연도가 붙는 경우.
- 출력에 나타날 모든 식별자에 대해 해당 레코드를 가져오세요.
- 레코드를 주장과 일치시키세요. 확인된 PMID는 논문이 존재한다는 것만 증명할 뿐, 답변이 그 논문에 귀속시키는 내용을 말해준다는 것은 아닙니다. 최소한 초록을 읽고, 측정 방법에 대한 주장이 있을 때는 방법론 부분을 읽으세요.
- 출력에 출처 정보를 포함하세요 — 식별자, 제목, 연도 및 해당 출처가 실제로 뒷받침하는 내용.
출처를 확인할 수 없으면, 해당 주장을 출처 없이 쓰거나 제거하세요. "이에 대한 참고문헌을 찾을 수 없습니다"라고 말하는 것이 올바른 답변입니다.
데이터베이스 레코드도 출처 정보를 갖습니다. 레코드는 accession과 함께, 리소스가 데이터를 버전 관리하는 경우 릴리스 또는 버전과 검색 일자를 기재하여 인용합니다 — UniProt P04626 (retrieved 2026-11-13), PDB 1N8Z, Thera-SAbDab trastuzumab, IEDB epitope ID 12345. 데이터베이스 내용은 릴리스 간에 변경되므로, 버전 없는 단순 accession은 재현 불가능합니다. 이차 요약보다는 일차 출처(기탁된 레코드)를 선호하세요.
질문에 맞는 리소스 선택하기
| 질문 | 이용할 곳 |
|---|---|
| 이 표적, 항체 또는 방법에 대해 출판된 내용은 무엇인가요? | Europe PMC 또는 PubMed |
| 이 단백질, 그 도메인, 이소폼, PTM, 서열은 무엇인가요? | UniProt |
| 이 항원에 대해 알려지거나 매핑된 에피토프는 무엇인가요? | IEDB |
| 이 복합체의 구조가 있나요? | RCSB PDB, 그 다음 SAbDab (VHH의 경우 SAbDab-nano)에서 항체 특이 주석 확인 |
| 이 표적에 대해 설계 전에 알아야 할 것은 무엇인가요? | 타겟 도시에: references/target-dossier.md |
| 이 표적 또는 이 방법에 대해 테스트된 설계 결합체는 무엇이며, 결과는 어땠나요? | Proteinbase |
| 보정할 수 있는 돌연변이 결합 또는 개발 가능성 데이터가 있나요? | SKEMPI 2.0, AB-Bind, Ginkgo Datapoints |
| 명명된 치료용 항체의 서열과 포맷은 무엇인가요? | Thera-SAbDab, IMGT/mAb-DB |
| 이 항체 서열이 이전에 출판되거나 특허 출원된 적이 있나요? | PLAbDab |
| 어떤 생식세포 유전자와 대립유전자가 존재하나요? | IMGT/GENE-DB, OGRDB |
| 이 레퍼토리 또는 클론타입이 연구에서 관찰된 적이 있나요? | OAS, iReceptor, VDJbase |
| 어떤 임상 시험이 존재하며, 어떤 단계인가요? | ClinicalTrials.gov, EU CTIS, WHO ICTRP |
| 승인되었거나 검토 중인 항체는 무엇인가요? | The Antibody Society's table, YAbS |
| 이 서열이 특허에 청구된 적이 있나요? | Google Patents, Lens.org, patent sequence databases |
| 이 단백질을 표적으로 하는 상업용 항체는 무엇이며, 검증되었나요? | antibody-reagent-selection |
세부 정보, URL 및 API 노트: references/resources.md. 쿼리 구문 및 작업 예제: references/search-recipes.md.
immuno MCP 사용 시
immuno MCP 서버가 연결되면(get_server_capabilities로 확인), 다음 단계에 대해 수동 쿼리보다 이를 선호하세요. 모든 결과에는 인용할 provenance가 포함됩니다.
resolve_identifier는 PDB ID, UniProt accession, PMID, PMCID 또는 DOI를 쓰기 전에 확인합니다.search_antibody_structures는 SAbDab2를 쿼리합니다. 단백질 이름이 아닌 UniProt accession으로 검색하세요: "PD-1" 또는 "Programmed cell death protein 1"과 같은 이름으로 VHH 필터를 적용하면 2026-11-14 기준 0행을 반환한 반면, accession Q15116은 51행을 반환했습니다. 이름 필터는 25자를 매칭하며, 종을 확인하지 않고, 항원을 다르게 명명한 항목을 놓칩니다. 그런 다음get_structure로 엔트리, CDR 및 항원 사슬을 가져옵니다.search_literature후get_passages로 텍스트를 읽고 인용합니다. 제목만으로는 증거가 되지 않으며, passages는coverage가 전문(full text)이라고 표시하지 않는 한 초록 전용입니다.query_binding_data는 SKEMPI 2.0 행(ddG, Kd, 출처 PMID)을 반환합니다. 데이터셋은 2018년 기준입니다.- 서버가 계획 중이라고 나열하는 데이터셋(OAS, AB-Bind, GDPa1, Adaptyv)은 아직 쿼리할 수 없습니다. 인용하지 말고 그렇게 말하세요.
검색 폭
단일 쿼리로는 이 분야에서 거의 아무것도 답할 수 없습니다. 단순 조회를 넘어서는 모든 질문에 대해, 한 번에 여러 검색을 실행하고 어휘를 다양화하세요. 동일한 대상은 많은 이름을 갖기 때문입니다:
- 표적: 유전자 기호, 단백질 이름, CD 번호, 이전 이름, 종.
- 항체: INN, 코드명 (종종
ABC-123), 브랜드명, 클론 ID, 개발사. - 개념: 방법 이름과 일반적인 약어.
다양한 어휘에서 동일한 논문이 계속 반환될 때 중단하세요. 그 포화 상태가 완료 기준이지, 고정된 검색 횟수가 아닙니다.
증거를 첨부하여 요약하기
답변에 포함될 각 논문에 대해 references/reading-a-paper.md의 필드(표적, 항체 및 포맷, 측정된 것과 방법, 모델 시스템, 대조군, 효과 크기, 한계)를 추출하고 다음을 전체적으로 구분하세요:
- 측정된 것과 결론 내려진 것,
- 시험관 내, 동물 및 인간 증거,
- 피어 리뷰 논문 vs 프리프린트 vs 학회 초록 vs 회사 보도자료.
최신성이나 강조 정도보다 이 계층 구조로 주장의 순위를 매기세요. 긍정적인 2상 결과를 보고하는 보도자료는 출판된 임상 시험보다 약한 증거이며, 둘 다 그 성격에 맞게 표시되어야 합니다.
예의 바르게 가져오기
여기 있는 공개 API는 무료이며 속도 제한이 있습니다. 요청을 배치하고, 문서화된 제한을 준수하며, 결과를 스크래치패드에 캐싱하여 다시 가져오지 마세요.
NCBI의 E-utilities는 호출자가 tool 및 email 매개변수로 자신을 식별하도록 요청합니다. 일반적인 클라이언트 이름을 보내고, 사용자에게 자신의 이메일 주소를 외부 서비스에 대한 요청에 포함시키기 전에 물어보세요.