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mims-harvard/tooluniverse-sequence-retrieval

從NCBI和ENA檢索DNA/RNA/蛋白質序列,並具有消歧功能。品質層級:RefSeq (NM_/NP_) > RefSeq預測 (XM_/XP_) > GenBank提交。用於依登錄號擷取特定序列、基因符號對序列查詢、轉錄本異構體檢索,以及偏好審核版而非原始提交版。

tooluniverse-sequence-retrieval 是什麼?

mims-harvard/tooluniverse-sequence-retrieval 是一個專門為AI代理和生物資訊學工具設計的技能,用於從NCBI(美國國家生物技術資訊中心)和ENA(歐洲核苷酸檔案庫)高效擷取高品質的DNA、RNA或蛋白質序列。此技能的一大特點是內建序列品質消歧機制,會優先選擇經審核的 RefSeq 序列(如 NM_、NP_ 前綴的登錄號),其次才是 RefSeq 預測序列(如 XM_、XP_ 前綴),最後才是原始 GenBank 提交。這項功能讓使用者能夠在擷取特定轉錄本異構體或根據基因符號查找對應序列時,自動獲得最可靠的版本。該技能支援多種存取方式,包括直接透過登錄號、基因符號進行序列擷取,並能處理轉錄本異構體檢索。它非常適合整合到如 Claude Code、Cursor 或 Codex 等AI開發工具中,特別是在需要進行序列比對、基因功能分析或生物資訊學 pipeline 的場景下,能顯著提升數據擷取的準確性和效率。

相容平台~Claude Code~Codex CLI~Cursor
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tooluniverse-sequence-retrieval 是做什麼的?

從NCBI和ENA檢索DNA/RNA/蛋白質序列,並具有消歧功能。品質層級:RefSeq (NM_/NP_) > RefSeq預測 (XM_/XP_) > GenBank提交。用於依登錄號擷取特定序列、基因符號對序列查詢、轉錄本異構體檢索,以及偏好審核版而非原始提交版。

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