p123p2000/synbio-igem-skills

Transforme ideias de pesquisa em biologia sintética, projetos iGEM, cursos ou atividades de divulgação científica em um plano de execução com dependências, critérios de evidência e pontos de verificação. Adequado para planejamento, design e revisão; não substitui a confirmação de conclusões científicas ou regras oficiais da competição.

O que é synbio-igem-skills?

Este skill auxilia equipes a transformar conceitos de biologia sintética (pesquisa, iGEM, cursos ou divulgação) em um roteiro executável e bem estruturado. Diferente de um simples checklist, ele gera três visões interligadas (mapa de resultados, mapa de dependências e portões de evidência) que permitem saber exatamente o que precisa ser validado primeiro, quais recursos são necessários, qual nível de evidência é suficiente para prosseguir e quando mudar de estratégia. Ele é útil especialmente para projetos onde o conhecimento é incerto e as dependências são complexas, como competições iGEM ou prototipagem de novos circuitos biológicos. O skill funciona como um guia de planejamento que se adapta ao tipo de atividade (projeto, curso ou divulgação), extraindo do usuário restrições iniciais e preenchendo premissas de trabalho reversíveis. Ele suporta integração opcional com outros skills (synbio-expert, igem-mentor, etc.) para gerar cartões de evidência, mas nunca bloqueia a entrega se eles estiverem ausentes. Em plataformas como OpenMAIC, ele produz um resumo de curso pronto para publicação, porém com a ressalva de que o conteúdo deve ser revisado antes do uso.

Funciona com~Claude Code~Codex CLI~Cursor
npx skills add https://github.com/p123p2000/synbio-igem-skills/tree/HEAD/skills/synbio-planner

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Documentação

Blueprint de Biologia Sintética

O objetivo do planejamento não é expandir uma ideia em um texto longo, mas sim fazer com que a equipe saiba o que precisa ser validado primeiro, quem depende de quem, quais evidências são suficientes para continuar e quando é hora de mudar de direção.

Escolher o tipo de blueprint

Três mapas para completar o planejamento

Crie três visões mutuamente correspondentes para a tarefa escolhida; tarefas pequenas podem ser combinadas, mas não podem perder sua lógica.

1. Mapa de Resultados

Descreva claramente o público-alvo, a mudança desejada, os resultados observáveis e o método de verificação. Trate “fazer experimentos, realizar eventos, elaborar materiais didáticos” como tarefas, não como efeitos em si.

2. Mapa de Dependências

Liste item por item: papel do responsável, entradas, recursos, pré-condições e entregas. Orçamento, equipamentos, colaborações, aprovações e pessoal ainda não confirmados devem ser marcados como dependências, não disfarçados de condições existentes.

3. Portões de Evidência

Para cada fase crítica, escreva: condições para continuar, condições para pausar, fontes que precisam ser revisadas e caminhos alternativos. Estimativas devem manter hipóteses e fórmulas; dados simulados, entrevistas simuladas e exemplos de resultados devem ser explicitamente rotulados como simulação didática.

Regras de planejamento

  1. Primeiro extraia do usuário o tempo, pessoal, capacidade, recursos, público e restrições já fornecidos; depois preencha premissas de trabalho reversíveis.
  2. Separe fatos externos de decisões da equipe. O embasamento científico deve ser apoiado por artigos originais ou materiais de fontes confiáveis; os requisitos de qualificação, taxas, prazos e segurança do iGEM devem ser verificados conforme as fontes oficiais do ano correspondente.
  3. A granularidade das tarefas deve permitir transferência e verificação. Cada tarefa deve pelo menos responder a “quem, o que entrega, de quem depende, como saber se está concluída”.
  4. Primeiro agende uma validação em pequena escala que exponha as principais incógnitas; depois decida se expande. O objetivo e as condições de aprovação da validação em pequena escala devem ser previamente definidos.
  5. Ao alterar o objetivo, verifique simultaneamente dependências, orçamento, método de avaliação e registro de riscos; evite modificar apenas o título ou resumo.
  6. Planos relacionados à biologia devem fornecer apenas design conceitual e de gerenciamento compatível com a tarefa. Conteúdos sobre organismos perigosos, aprimoramento de danos ou evasão de detecção não devem ser convertidos em etapas executáveis de otimização.

Saída e colaboração

Entregue um blueprint pronto para uso imediato: escopo, três mapas, tarefas de curto prazo, pendências e pontos de revisão. Quando o usuário desejar uma versão resumida, comprima a apresentação sem preencher modelos mecanicamente.

Outros Skills são colaboradores opcionais: synbio-expert fornece cartões de evidência; igem-mentor fornece evidências da competição do ano; synbio-knowledge-base armazena materiais rastreáveis; synbio-video e synbio-cue-cards tratam de entregas de comunicação explicitamente solicitadas. Quando ausentes, mantenha os campos de interface e continue o blueprint atual, sem declarar sucesso na chamada.

Ao enviar para plataformas de sala de aula como OpenMAIC, produza um resumo de curso no formato “público—resultados de aprendizado—capítulos—interações—testes—fontes—itens proibidos de extrapolação”. A plataforma gera a página, mas o conteúdo ainda precisa ser revisado. Escopo de manutenção e referências em Notas de Fonte.

Individual skills in this repo

This repo contains 4 individual skills — each has its own dedicated page.

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