p123p2000/synbio-igem-skills

Transforme des idées de recherche en biologie synthétique, des projets iGEM, des cours ou des activités de vulgarisation en un plan d'exécution comprenant dépendances, seuils de preuve et critères de validation. Convient à la planification, à l'analyse rétrospective et au pilotage ; ne se substitue pas à la validation scientifique ni aux règles officielles de l'année.

Qu'est-ce que synbio-igem-skills ?

Ce Skill génère un plan d'exécution structuré (ou « blueprint ») pour tout projet de biologie synthétique, iGEM, cours ou activité de vulgarisation. L'utilisateur choisit d'abord un type de plan (recherche/iGEM, cours ou événement grand public), pour lequel le Skill applique une méthodologie en trois vues interconnectées : le diagramme des résultats (ce qui doit changer chez le public cible), le diagramme des dépendances (ressources, prérequis, livrables) et les portes de validation (conditions pour continuer, mettre en pause ou changer de cap). Chaque tâche doit être suffisamment fine pour être transférée et validée ; le Skill impose une vérification à petite échelle avant toute expansion. Il distingue strictement les faits externes (appuyés par des publications ou des sources officielles iGEM) des décisions d'équipe, et marque explicitement toute donnée simulée comme « à but pédagogique ». Le plan final inclut un périmètre, les trois diagrammes, les tâches immédiates, les points en suspens et des jalons de révision. Le Skill peut collaborer avec d'autres experts (synbio-expert, igem-mentor, synbio-knowledge-base) mais continue son travail si ces derniers sont absents. Il est compatible avec des plateformes comme OpenMAIC.

Compatible avec~Claude Code~Codex CLI~Cursor
npx skills add https://github.com/p123p2000/synbio-igem-skills/tree/HEAD/skills/synbio-planner

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Documentation

Plan d'exécution pour la biologie synthétique

Le but de la planification n'est pas de transformer une idée en un long texte, mais de permettre à l'équipe de savoir quoi valider en premier, qui dépend de quoi, quelles preuves suffisent pour continuer, et quand il est temps de changer de cap.

Choisir le type de plan

Trois diagrammes pour finaliser la planification

Établissez trois vues correspondantes pour la tâche choisie ; pour les petites tâches, elles peuvent être combinées, mais leur logique ne doit pas être perdue.

1. Diagramme des résultats

Indiquez clairement le public cible, le changement souhaité, les résultats observables et les méthodes de validation. Considérez « faire une expérience, organiser un événement, créer un support de cours » comme des tâches, et non comme des effets en eux-mêmes.

2. Diagramme des dépendances

Détaillez pour chaque élément : le rôle responsable, les entrées, les ressources, les prérequis et les livrables. Lorsque le budget, l'équipement, la collaboration, les approbations et le personnel ne sont pas encore confirmés, marquez-les comme dépendances ; ne les présentez pas comme étant déjà en place.

3. Portes de validation

Pour chaque étape clé, indiquez : les conditions pour continuer, les conditions pour marquer une pause, les sources à vérifier et les options alternatives. Les estimations doivent conserver les hypothèses et les formules de calcul ; les données simulées, les entretiens simulés et les exemples de résultats doivent être explicitement marqués comme « à but pédagogique ».

Règles de planification

  1. Extrayez d'abord les contraintes déjà fournies par l'utilisateur (temps, personnel, compétences, ressources, public) puis comblez les lacunes avec des hypothèses de travail réversibles.
  2. Séparez les faits externes des décisions d'équipe. Les bases scientifiques doivent être appuyées par des articles originaux ou des documents provenant de sources fiables ; les conditions d'éligibilité iGEM, les frais, les délais et les exigences de sécurité doivent être vérifiés sur les sources officielles de l'année correspondante.
  3. La granularité des tâches doit permettre le transfert et la validation. Chaque tâche doit au moins répondre à « qui, quoi, de quoi elle dépend, comment juger qu'elle est terminée ».
  4. Planifiez d'abord une validation à petite échelle qui expose les principales inconnues, puis décidez de l'extension. Le but et les critères de réussite de cette validation doivent être écrits à l'avance.
  5. Lorsque l'objectif change, vérifiez simultanément les dépendances, le budget, les méthodes d'évaluation et le registre des risques ; ne modifiez pas seulement le titre ou le résumé.
  6. Les plans liés à la biologie ne fournissent qu'une conception conceptuelle et managériale proportionnée à la tâche. Les contenus concernant des organismes dangereux, l'amélioration de la nocivité ou le contournement de la détection ne sont pas convertis en étapes d'optimisation exploitables.

Sortie et collaboration

Livrez un plan prêt à exécuter : périmètre, trois diagrammes, tâches immédiates, points en suspens et jalons de révision. Si l'utilisateur souhaite une version simplifiée, condensez la présentation sans remplir mécaniquement le modèle.

Les autres Skills sont des collaborateurs optionnels : synbio-expert fournit des cartes de preuves ; igem-mentor fournit les preuves de l'édition en cours ; synbio-knowledge-base conserve les documents traçables ; synbio-video et synbio-cue-cards traitent les livrables de diffusion explicitement demandés. S'ils sont absents, conservez les champs d'interface et continuez à produire le plan actuel, sans déclarer un appel réussi.

Lorsque la sortie est transmise à une plateforme de classe comme OpenMAIC, produisez un résumé de cours au format « public—objectifs d'apprentissage—sections—interactions—quiz—sources—points interdits d'extrapolation » ; après génération de la page par la plateforme, une relecture du contenu reste nécessaire. Voir Notes sur les sources pour la maintenance et le périmètre de référence.

Individual skills in this repo

This repo contains 4 individual skills — each has its own dedicated page.

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