ccxbu710-spec/excel-pubmed-fulltext-review

excel-pubmed-fulltext-review は何をしますか？

Excel PubMed全文ダウンロード、機関補完、文献解釈サマリーのためのCodexスキル。

概要

このスキルは、Excelに保存されたPubMed検索結果を処理し、以下の機能を提供します：

• 各論文の全文PDFの自動ダウンロード（オープンアクセスまたは機関サブスクリプション経由）
• 著者所属機関情報の標準化と補完
• 各論文の主要な発見と意義を日本語で要約

使用方法

1. PubMed検索結果をExcelファイルとして用意します（PMID列を含むこと）。
2. Codex環境でこのスキルをアクティベートします。
3. スキルにExcelファイルのパスを指定して実行します。

依存関係

• pandas
• biopython
• requests
• openpyxl

環境変数

• PUBMED_API_KEY: PubMed APIキー（オプション、レート制限緩和用）
• INSTITUTION_EMAIL: 機関メールアドレス（全文アクセス用）

出力

スキルは以下の内容を含む新しいExcelファイルを生成します：

• 元のPubMed結果
• 全文PDFのステータス（ダウンロード済み/未入手）
• 補完された機関名
• 日本語サマリー

注意事項

• 全文ダウンロードは著作権法および利用規約を遵守してください。
• 機関アクセスの設定は各自の環境に応じて行ってください。