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ccxbu710-spec/excel-pubmed-fulltext-review

코덱스(Codex)가 엑셀 기반의 PubMed 전문(full-text) 다운로드, 기관 정보 보완, 문헌 해석 요약을 수행할 수 있도록 하는 스킬입니다.

excel-pubmed-fulltext-review란 무엇인가요?

이 스킬은 사용자가 제공한 PubMed 결과(보통 엑셀 파일)를 기반으로 각 논문의 전문(full-text)을 다운로드하고, 기관(소속) 정보를 완성하며, 각 논문에 대한 해석 요약을 생성하는 Codex(Claude Code 등) 전용 스킬입니다. 주로 생명과학·의학 연구자나 리뷰어가 문헌 검토 작업을 대폭 자동화할 때 유용합니다. 이 스킬은 엑셀 파일의 컬럼 구조(PMID, DOI, 제목, 저자, 저널 등)를 인식하여 동작하며, PDF 다운로드 실패 시에도 우회 경로를 시도하고, 최종적으로 각 논문에 대한 간결한 해석 요약(연구 목적, 방법, 주요 결과, 한계점 등)을 포함한 새로운 엑셀 시트를 생성합니다. 또한 각 논문의 저자 소속 기관을 자동으로 보완하여 메타데이터의 완성도를 높입니다. 코드 실행과 웹 검색을 병행하며, 다양한 PubMed 내보내기 포맷에 대응할 수 있도록 설계되었습니다.

지원 대상~Claude Code✓Codex CLI~Cursor
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excel-pubmed-fulltext-review은(는) 무엇을 하나요?

Codex가 Excel 기반 PubMed 전문(full-text) 다운로드, 기관 정보 보완, 문헌 해석 요약을 수행할 수 있도록 하는 스킬입니다.

설명

이 스킬은 사용자가 제공한 PubMed 검색 결과(엑셀 파일)에서 각 논문의 전문(full-text)을 다운로드하고, 저자의 기관 정보를 완성하며, 각 논문에 대한 해석 요약을 생성합니다.

주요 기능

  • 전문(full-text) 다운로드: PMID 또는 DOI를 기반으로 PubMed Central, DOI.org 등에서 PDF를 자동 다운로드합니다.
  • 기관 정보 보완: 각 논문의 저자 소속 기관 정보를 PubMed API를 통해 조회하여 엑셀에 자동으로 채웁니다.
  • 문헌 해석 요약: 각 논문에 대해 연구 목적, 방법, 주요 결과, 한계점 등을 포함한 간결한 해석 요약을 생성합니다.
  • 엑셀 출력: 모든 결과를 구조화된 새로운 엑셀 시트로 출력합니다.

지원 플랫폼

  • Codex (Claude Code, Cursor 등)
  • Python 3.8+ (requests, openpyxl, pandas 등 필요)

사용 방법

  1. PubMed에서 검색 결과를 엑셀(.xlsx) 형식으로 내보냅니다.
  2. Codex에게 엑셀 파일을 제공하고 ccxbu710-spec/excel-pubmed-fulltext-review 스킬을 활성화합니다.
  3. 스킬이 자동으로 각 논문의 전문을 다운로드하고, 기관 정보를 보완하며, 해석 요약을 생성합니다.
  4. 결과는 [원본파일명]_review.xlsx로 저장됩니다.

참고

  • 모든 논문에 대해 전문을 무료로 이용할 수 있는 것은 아닙니다. 오픈 액세스 논문에 최적화되어 있습니다.
  • PubMed API 사용량 제한을 고려하여 적절한 지연(delay)을 두고 요청을 보냅니다.
  • 대량의 논문(100개 이상) 처리 시 시간이 오래 걸릴 수 있습니다.

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