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抗体治療薬ランドスケープ

抗体治療薬の分子フォーマット(IgGサブクラス、Fab、scFv、VHH、二重特異性抗体、ADC、Fc工学)、薬剤名の解読、発見から承認までの経路、規制経路、開発可能性、CMC、商業用語、ナノボディ(VHH)医薬品、設計ツールや提案におけるユーザーフィットと価値への道筋の議論、さらにバイオテクノロジー企業研究と面接準備までをカバーします。抗体医薬品、モノクローナル抗体やナノボディのフォーマット、抗体関連企業やバイオテク企業がプロンプトに登場した場合、バイオテク用語の意味を尋ねられた場合、設計結果のユーザーや購入者を問われた場合、またはバイオテク職種、求人広告、面接について質問された場合に使用します。承認数、パイプライン、企業情報は変動するため常に検索し、記憶に頼ってはいけません。論文、治験、データベースレコードの検索にはantibody-literature-searchを、研究室用抗体選択にはantibody-reagent-selectionを、配列データにはantibody-sequence-bioinformaticsを使用してください。

抗体治療薬ランドスケープ とは?

このスキルは、AIエージェント(Claude Code, Cursor, Codex等)向けに設計された、抗体治療薬の包括的な知識ベースと推論フレームワークです。抗体医薬品を分子フォーマット、作用機序、規制経路、商業的価値に至るまで体系的に分析するための「ビジネス&オリエンテーション」スキルであり、実験ベンチ、文献検索、配列解析はそれぞれ別のスキルが担当します。主な機能は、(1) 任意の抗体医薬品を「標的とエピトープ」「分子フォーマット」「作用機序」「適応症・ライン・患者集団」「差別化要因」の5つの質問で特徴づけること、(2) 変動する事実(承認数、パイプライン情報、企業情報など)は常に外部データベース(The Antibody Society、ClinicalTrials.gov、FDA Purple Book等)を検索し、記憶や捏造を避けること、(3) 参照マークダウンファイル(formats.md, glossary.md, development-path.md, value-and-pitch.md, careers.md)を活用して、抗体フォーマットの解剖学、業界用語、開発パス、バリュープロポジション、キャリア情報までを提供します。このスキルは、AIエージェントが抗体医薬品のプロンプトに対して、正確で文脈に沿った、かつアップデートされた回答を生成するために不可欠です。

対応~Claude Code~Codex CLI~Cursor
npx skills add https://github.com/0xcvaliente/immunology-skills/tree/HEAD/antibody-therapeutics-landscape

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ドキュメント

治療用抗体ランドスケープ

医薬品としての抗体:分子とは何か、どのようなフォーマットをとるか、標的アイデアからラベル(承認表示)に至るまでどのように進むか、そしてその過程で使用される用語。これはビジネスとオリエンテーションのスキルです。実験ベンチ、文献、配列データはそれぞれ別のスキルに担当があります。

変動する事実は検索すること

回答する前に、すべての事実主張を永続的(durable) または変動的(volatile) に分類してください。

  • 永続的 — 免疫学、分子フォーマット、作用機序、アッセイ原理、規制経路の形状、用語の意味。知識から回答します。
  • 変動的 — 承認されている抗体の数、該当するもの、承認日、アセットの所有者やライセンシー、各治験フェーズにあるもの、取引価値、従業員数、買収した企業とされた企業。これらは毎回検索し、数値とともに検索日を提示してください。

質問別の検索先:

質問ソース
承認済みまたは規制審査中The Antibody Societyの表(ログイン不要)、次にFDA Drugs@FDA / Purple Book、EMA医薬品ページ
承認・未承認を問わずあらゆる抗体治療薬YAbS、Antibody Societyの検索可能な治療薬データベース(2,900以上の分子)
近期承認とパイプラインスイープ当年の mAbs 誌の「Antibodies to watch」レビュー(例: Crescioli et al., 2026)
治験、フェーズ、登録患者数ClinicalTrials.gov(API v2)、EU CTIS;米国/EU以外の登録機関も含めたグローバルスイープにはWHO ICTRPを追加
薬剤名の語幹や接尾辞の意味WHO INN語幹ブックおよび現在のmAb命名体系
所有者、コスト、今後の展開企業自身のIR資料と年次報告書
構造と治療用配列SAbDab、Thera-SAbDab、IMGT/mAb-DB(antibody-literature-searchを参照)

セッション内で検索が不可能な場合は、もっともらしい事実を提示する代わりに、未検証の事実を明記してください。記憶に頼った承認数は間違っていることが多く無価値であり、捏造されたものはさらに悪質です。

あらゆる抗体医薬品を特徴づける

5つの質問。すべてに回答すればアセットは理解されたことになります。不明な点は明示的にマークしてください。

  1. 標的とエピトープ — どの抗原、どのドメインやコンフォメーションか、そして結合が遮断、アゴナイズ、除去、架橋、デリバリーのうちどれを意図しているか。
  2. フォーマット — サブクラス、フラグメント、二重特異性、コンジュゲート、およびそのフォーマットがもたらす利点。references/formats.mdを参照。
  3. 作用機序 — 結合から臨床効果に至る因果連鎖:受容体遮断、アゴニズム、エフェクター動員(ADCC、ADCP、CDC)、ペイロード送達、T細胞リダイレクション、タンパク質架橋、受容体内在化。
  4. 適応症、ライン、患者集団 — 疾患、治療シーケンスにおける位置、および適格性を決めるバイオマーカーの有無。
  5. 差別化要因 — その標的または適応症に対処する他の治療法と、この治療法を際立たせるもの:効力、半減期、投与経路と投与スケジュール、安全性プロファイル、製造可能性、価格。

参照

  • references/formats.md — 免疫グロブリン解剖学、IgGサブクラス、フラグメント、医薬品としてのVHH、二重特異性抗体アーキテクチャ、ADC解剖学、Fc工学、および薬剤名の解読。
  • references/glossary.md — 登場場所ごとにグループ化された実務用語集:結合、発見、開発可能性、PKとエフェクター機能、臨床、規制、CMC、商業。
  • references/development-path.md — 標的からラベルまで、米国・EU・ノルウェーでの規制経路、バイオシミラー、およびプログラムを頓挫させる要因。
  • references/value-and-pitch.md — 設計ツールや結果に対するユーザーフィットと価値への道筋:誰が何を購入するか、価値がどこにあるか、何が防御可能か、臨床問題からプロパティへの変換表、ナノボディのセールスポイント。
  • references/careers.md — バイオテク求人広告の読み方、職種ファミリー、ITとデータの観点、企業研究、面接準備。

Individual skills in this repo

This repo contains 2 individual skills — each has its own dedicated page.

antibody-literature-search

Find and summarise antibody and immunology literature and public database records - papers on a target, antibody or method, the originator publication for a named mAb, UniProt entries, PDB, SAbDab and SAbDab-nano structures, Thera-SAbDab therapeutic sequences, IMGT germlines, clinical trials, patent sequences, and measured design data in Proteinbase. Use when asked what is known or published about an antigen, antibody, epitope or assay, to look up an accession, PDB ID, PMID or DOI, to summarise a paper, to profile a target before designing against it (a target dossier covering construct, structures, known binders and epitopes, orthologs, accessibility and clinical context), or to assemble evidence on an antibody target. Every identifier is resolved against the source before it is written. Use antibody-therapeutics-landscape for industry and format context, antibody-reagent-selection to choose a commercial antibody, antibody-sequence-bioinformatics to work with the sequence...

antibody-sequence-bioinformatics

Work with antibody, nanobody (VHH) and BCR sequence data - numbering schemes (IMGT, Kabat, Chothia, Martin, AHo), CDR and framework boundaries, VHH hallmark residues and cysteine checks, germline assignment with ANARCII, ANARCI, abnumber or IgBLAST, mapping CDRs onto a structure's residue numbers for loop-redesign contigs, interface contacts and hotspot coverage of a predicted complex, repertoire pipelines, the AIRR Rearrangement TSV format, clonotype grouping, humanness, and sequence liability motifs. Use when parsing, numbering, annotating, QC-ing or filtering antibody, VHH or designed binder sequences, when a CDR definition or region coordinate is in question, when a contig needs PDB residue numbers, or when writing code against AIRR, IgBLAST, ANARCI or OAS data. Every region coordinate carries the name of its numbering scheme. Use antibody-binder-design for the design workflow, antibody-literature-search to find sequences and structures, antibody-therapeutics-landscape...

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