临床报告 是做什么的?
目的
从已验证的授权事实中准备草稿报告结构、汇总表格和评审清单。将每个成品路由到正确的报告指南,保留溯源,并在缺少源支持或合格评审时停止。
此技能不确立法律、法规、伦理、期刊、认证或机构合规性。其脚本仅检查结构和内部一致性。
不可协商的边界
绝不:
- 诊断、推荐治疗、选择或更改剂量、分诊或提供返回注意事项;
- 解释图像、标本、原始实验室结果、症状或其他临床观察;
- 发明、推断、归一化、“完成”或默默协调观察、结果、日期、单位、分母、因果关系、预期性、严重性、结果或结论;
- 基于患者层面叙述创建个例安全性报告或决定可报告性;
- 签署、认证、批准、归档、传输、提交、修改源记录,或担任持证临床医师、病理学家、放射科医生、检验科医生、安全医师、统计学家、隐私官、律师或法规专业人员;
- 在示例、资产、测试、提示、日志或外部服务中使用真实的受保护健康信息(PHI);
- 调用外部LLM、图像服务、API或其他技能。
所有生成的成品必须保持可见标记:
草稿 — 不用于临床用途、签署、归档或提交。仅从已验证的授权源记录中填充。需要合格评审和签字。
如果请求跨越边界,停止不安全的部分。提供空白结构化模板、源事实清单或确定性结构检查。将临床或法规决策引导至负责的合格专业人员。
输入门控
仅当所有条件都满足时才能继续:
- 目的是明确的:出版物草稿、诊断报告框架、试验结果手稿、方案报告评审、CSR草稿、汇总安全性表格或汇总研究摘要。
- 数据类别是允许的:
synthetic(合成)、deidentified(去标识)或aggregate(汇总)。 - 权限已记录:请求者有权将记录用于所述目的。
- 仅本地处理可行:无需上传、远程API、遥测或凭据。
- 定义了最低必要:排除成品不需要的字段。
- 溯源存在:每个填充的字段或声明映射到一个或多个已验证的源事实ID。
- 确定了评审负责人:根据需要具有临床、统计、安全、隐私、法律、期刊和/或法规评审资格。
当可以提供结构化源事实清单时,不要接受原始的纯文本患者记录。不要将直接标识符复制到此技能的模板或脚本中。
起草前路由
| 成品 | 主要路由 | 重要边界 |
|---|---|---|
| 用于发布的病例报告 | CARE 2013检查表和2017解释 | 发布同意书、隐私、期刊政策和临床准确性需要人工验证 |
| 放射学报告草稿框架 | ACR 2025沟通实践参数加上特定模态的ACR材料 | 合格的放射科医生撰写发现/印象并处理非常规沟通 |
| 病理学报告草稿框架 | 当前针对标本的特定CAP癌症方案(如适用) | 合格的病理学家选择方案/版本并撰写诊断 |
| 实验室报告草稿框架 | 42 CFR 493.1291和实验室政策 | 执行实验室控制结果、参考区间、更正和发布 |
| 随机试验结果报告 | CONSORT 2025加上每个适用的当前扩展 | CONSORT是报告指南,不是行为或提交标准 |
| 随机试验方案报告 | SPIRIT 2025加上适用扩展 | SPIRIT用于方案,而不是结果或CSR |
| 临床研究报告 | ICH E3加上E3 Q&A;考虑ICH E6(R3)和地区要求 | E3是可调整的指南,不是严格的通用模板 |
| 批准前安全性报告 | ICH E2A;E2B(R3)用于电子ICSR数据;适用的地区法律/指南 | 合格申办方/研究者安全评估控制可报告性和时机 |
| 批准后个例安全性报告 | ICH E2D(R1)、E2B(R3)和地区要求 | 不要自动化案例评估、编码或提交 |
| 汇总安全性演示 | 方案/SAP、ICH E3、CONSORT Harm以及适用的FDA/ICH指南 | 汇总表格从不决定个例可报告性 |
| 汇总研究摘要 | 针对研究设计的特定报告指南和源方案/SAP | 准确陈述人群、估计量、分母、缺失性和局限性(与已验证的一致) |
在选择路由之前阅读 references/report_type_routing.md。使用 references/sources.md 中带日期的官方来源账本;当要求可能发生变化时,检查官方实时来源。
安全起草工作流程
1. 创建源事实清单
使用 assets/provenance_manifest_template.json。仅记录本地记录定位器、字段路径、验证状态、验证者角色、验证日期和SHA-256值哈希。不要复制源内容或直接标识符。
每个草稿声明或填充字段必须引用一个或多个事实ID。不受支持的内容保持为 null 或 missing;绝不用看似合理的文本替换。
2. 生成正确的模板
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/generate_report_template.py --list
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/generate_report_template.py \
--type case-report \
--output ./case-report-draft.json
生成器复制一个默认关闭的JSON模板。它不填充临床内容、创建目录、默认覆盖文件或认证就绪状态。
3. 仅填充已验证字段
- 保持
draft_status不变。 - 仅当已验证的事实ID支持该字段时才替换
null。 - 准确记录不确定性及“未评估”。
- 不要将原始观察转化为诊断、编码、分级、分期、严重性、因果关系、预期性、严重程度或建议。
- 仅在合格评审者提供了理由时才使用
not_applicable_with_rationale。 - 保持源记录和草稿的分离。
4. 运行确定性检查
CARE结构:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/validate_case_report.py \
./case-report-draft.json
ICH E3、CONSORT 2025或SPIRIT 2025结构:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/validate_trial_report.py \
./trial-report-manifest.json
汇总不良事件表格:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/format_adverse_events.py \
./aggregate-ae.csv --metadata ./safety-aggregate.json \
--output ./aggregate-ae-table.md
术语模式:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/terminology_validator.py \
./terminology-manifest.json
去标识化过程文档:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/check_deidentification.py \
./deidentification-process.json
可追溯性和一致性:
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/provenance_validator.py ./provenance.json
PYTHONDONTWRITEBYTECODE=1 python3 scripts/consistency_checker.py ./consistency.json
这些工具使用Python标准库、本地边界文件和没有网络、动态评估、序列化代码执行或患者记录提取。成功的结果仍然表明需要审查。
5. 应用正确的审查
至少:
- 临床事实和解释:相关专业的合格临床医生;
- 统计结果、人群、估计量、分母和缺失性:合格统计学家;
- 安全编码、严重性、因果关系、预期性和可报告性:合格安全专业人员;
- HIPAA、同意书、授权和披露:隐私/法律/机构审查;
- CSR或法规安全输出:申办方法规和医学审查;
- 发布:所有负责作者和目标期刊检查。
不得代表他人签署或提交。
病例报告
使用 assets/case_report_template.json 和 references/case_report_guidelines.md。
- CARE当前的核心检查表仍然是2013年检查表。
- 仅报告已验证记录所支持的内容。
- 不要将病例变成临床建议或从单个病例泛化因果关系。
- 患者视角和知情同意状态必须准确记录;不要起草虚假同意声明。
- 去标识化和同意是独立的控制措施。同意并不消除隐私风险。
诊断报告框架
使用放射学、病理学或实验室JSON资产和 references/diagnostic_reports_standards.md。
- 资产是字段映射,不是诊断编写系统。
- 绝不生成发现、印象、诊断、分级、分期、参考区间、临界阈值或随访建议。
- 保留初步/最终/更正状态和源系统版本。
- 对标本使用当前准确的CAP方案和版本;不要维护通用的癌症分期默认值。
- 沟通和更正操作由负责的临床服务保留。
之前的SOAP、H&P、会诊和出院总结界面已被移除。不要重新创建患者护理记录、用药计划、分诊指导、计费支持或处置建议。
试验、CSR和安全性报告
阅读 references/clinical_trial_reporting.md 和 references/safety_reporting.md。
- CONSORT 2025对于随机试验结果有30个最低条目;从当前官方目录中选择相关扩展。
- SPIRIT 2025对于随机试验方案有34个最低条目,并取代SPIRIT 2013。
- ICH E3仍然是CSR的基础;其2012年Q&A明确允许合理调整。
- ICH E6(R3)合并的原则、附录1和附录2于2026年6月16日通过;各地区实施可能不同。
- 区分严重性与重度,以及不良事件与疑似不良反应。
- ICH E2B(R3)定义了电子ICSR数据/消息结构;它不是汇总表格格式或可报告性决策规则。
- ICH E2D(R1)于2025年9月15日通过,涉及批准后个例安全性报告;汇总定期报告另行处理。
- FDA要求和电子提交途径因角色、产品、研究和日期而异。此技能从不归档或传输。
隐私
阅读 references/privacy_and_deidentification.md。
- 仅在本地处理最低必要数据。
- HHS根据45 CFR 164.514(b)认可安全港和专家决定。
- 安全港还要求没有实际知道剩余信息可以识别个人。
- 专家决定必须由具备适当资格的专家执行并记录。
- 检查表或模式扫描不能确立去标识化或HIPAA合规性。
- 罕见疾病、小群体、日期、自由文本、图像、元数据和准标识符的组合可能保留再识别风险。
资产
所有资产仅包含合成模式,且启动时被阻止:
assets/case_report_template.jsonassets/radiology_report_template.jsonassets/pathology_report_template.jsonassets/lab_report_template.jsonassets/clinical_trial_csr_template.jsonassets/clinical_trial_results_template.jsonassets/trial_protocol_reporting_checklist.jsonassets/clinical_trial_safety_aggregate_template.jsonassets/adverse_event_aggregate_input_template.csvassets/research_summary_template.jsonassets/deidentification_process_checklist.jsonassets/quality_review_checklist.jsonassets/provenance_manifest_template.jsonassets/terminology_manifest_template.jsonassets/consistency_manifest_template.json
参考文献
references/README.md— 安全使用和文件映射references/report_type_routing.md— 成品到指南的路由references/case_report_guidelines.md— CARE结构和出版物保障references/diagnostic_reports_standards.md— ACR、CAP和CLIA边界references/clinical_trial_reporting.md— CONSORT 2025、SPIRIT 2025、ICH E3/E6(R3)references/safety_reporting.md— ICH E2/FDA安全区别references/privacy_and_deidentification.md— HHS方法和限制references/medical_terminology.md— 版本化术语和模式检查references/data_presentation.md— 分母、单位、缺失性和汇总表格references/professional_review.md— 伦理、责任和签字references/sources.md— 官方来源账本,检查于2026-07-23
最终交接
声明:
- 成品类型和使用的确切指南/版本;
- 允许的数据类别和仅本地处理;
- 未解决的
null、missing、冲突和不受支持的声明; - 溯源和确定性检查结果;
- 所需的合格评审者;
- 草稿/非提交警告。
绝不要说“合规”、“HIPAA安全”、“经过临床验证”、“已批准”、“准备归档”或“准备提交”。
引用科学代理技能
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Kassis, T., Agarwal, V., He, Y., Patel, D., & Brueckner, A. M. (2026). Scientific Agent Skills: A Library of Procedural Knowledge for Research Agents. arXiv:2609.00065. https://doi.org/10.48550/arXiv.2609.00065