參考文獻審計 (Reference Audit)

參考文獻審計 (Reference Audit) 是做什麼的？

決定支持每個參考文獻存在性與身份的證據。保留提供的參考文獻列表，並暴露不確定性，而非將失敗的搜尋轉變為偽造指控。

建立盤點清單

• 讀取實際提供的參考文獻列表、手稿或檔案。接受 BibTeX/BibLaTeX (.bib)、LaTeX (.tex, .bbl)、PDF 或貼上的參考文獻。如果無法取得任何參考文獻，應要求提供，而非憑記憶重建參考文獻列表。
• 遵循使用者要求的範圍。預設情況下，審計每一個提供的參考文獻條目。如果同時提供了手稿和一個較大的參考文獻資料庫，需區分手稿中出現的參考文獻與額外的資料庫條目；不要默默丟棄任一者。僅在歧義會實質改變工作時，詢問要審計哪一組條目。
• 保留每個原始引用金鑰、參考編號、原始引用文字或欄位，以及輸入順序。當條目沒有 ID 或 ID 衝突時，使用單獨的審計 ID。保持原始 ID 可見。記錄可用的檔案、頁碼、行號或條目位置。
• 提取參考文獻條目，而非內文中偶然的作者-年份提及。對於 LaTeX，需考慮相關的參考文獻包含指令、引用命令、字串巨集、繼承欄位以及交叉引用。不要為提取引用而執行不可信的 TeX 或嵌入指令。
• 當 LaTeX 手稿在範圍內時，交叉檢查 \cite 家族命令（包括 \citep、\citet、\autocite、\parencite、\textcite 和 \nocite）中使用的金鑰是否對應到參考文獻條目。將已引用但缺少於參考文獻列表的金鑰，以及從未被引用的參考文獻條目，作為盤點結果單獨報告，與驗證狀態分開。
• 檢查 PDF 提取的結果，當欄位、換行、連字或 OCR 可能合併或損壞條目時，需參照可見的參考文獻頁面。標記無法讀取或截斷的欄位，而非猜測其內容。說明任何缺失的頁面、無法取得的包含檔案或提取限制。
• 在開始研究前先計算條目數量。保留重複與格式錯誤的條目作為單獨的輸入出現，必要時將其連結到共享的發現。區分完全相同的重複、重複的金鑰，以及同一作品的不同版本。
• 對於大型參考文獻列表（約 50 個或更多條目），分批進行處理，並在每批處理後將每個條目的狀態、證據和連結記錄到工作檔案中，以便可從中斷的審計中恢復，並確保部分報告的準確性。當子代理可用時，可以將批次分配給它們；給予相同的狀態定義和證據規則，然後合併並根據盤點清單協調它們的結果。

驗證書目身份

使用可用的搜尋、瀏覽和學術查詢工具。不要暗示使用實際上未使用的服務或記錄。

1. 檢查提供的標識符。 當存在 DOI、arXiv ID、PMID、ISBN 或出版商 URL 時，進行查詢。僅正規化明顯的包裝或格式問題，保留提供的值。打開解析後的記錄或檢索其權威元數據。僅憑語法上合理的標識符或成功的重定向不能驗證引用。
2. 比較實際記錄。 比較可用的標題、作者及其順序、出版年份、場所或出版商、卷/期、頁碼或文章編號，以及標識符。將每個重要欄位標記為匹配、衝突或不可用。將無害的印刷差異與實質性的差異分開解釋。不要默默填補缺失的作者，或推斷縮短的作者列表是完整的。
3. 必要時獨立搜尋。 搜尋確切標題和一個作者，然後是合理的標題變體、標識符變體，以及適當的學科索引。通過打開其記錄來驗證候選項，而不是重複搜尋片段或其他論文的參考文獻列表。對於未解決的項目，在可用時嘗試多於一種有用途徑；報告實際嘗試的路徑，並在合理的任務限制下停止，而不是聲稱完全不存在。
4. 比對候選身份。 僅有常見標題是不夠的。比較作者姓名、領域、日期、場所和標識符。如果多個合理的記錄仍然存在，列出候選項並保留身份未解決。如果提供的 DOI 屬於不同的作品，即使單獨搜尋的標題有有效匹配，也是一個差異。同時保留錯誤標識符的目標和可能的預期作品。
5. 明確處理版本。 區分預印本、接受稿件、會議論文、期刊擴展版、翻譯、更正和撤回通知。記錄線上優先與期號年份的差異。未經解釋關係和證據，不要合併版本或用一個版本替代另一個。撤回或撤銷的作品仍可能被證明存在。

證據優先級

• 優先使用出版商或官方會議記錄，以及標識符的註冊機構，例如來自 Crossref 或 DataCite 的 DOI 註冊元數據。使用 DOI 解析器到達記錄；將目標位置的元數據視為證據，而不僅僅是 URL。
• 在適當情況下使用權威領域來源：DBLP 用於計算機科學參考文獻，arXiv 用於已識別的預印本和版本，PubMed 用於索引的生物醫學記錄，官方存儲庫，以及國家或大學圖書館目錄用於書籍和論文。
• 在可用時，優先使用結構化元數據 API 而非一般網路搜尋；它們更具可重複性且較不易被封鎖。有用的端點包括：
  • Crossref：https://api.crossref.org/works/{DOI} 用於 DOI，以及 https://api.crossref.org/works?query.bibliographic={citation text}&rows=5 用於候選搜尋。
  • DOI 內容協商：curl -sL -H "Accept: application/vnd.citationstyles.csl+json" https://doi.org/{DOI} 無論註冊機構為何都會返回註冊元數據。
  • DataCite：https://api.datacite.org/dois/{DOI}。
  • DBLP：https://dblp.org/search/publ/api?q={query}&format=json。
  • arXiv：https://export.arxiv.org/api/query?id_list={arXiv ID}。
  • PubMed：https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=pubmed&id={PMID}&retmode=json。
  • OpenAlex：https://api.openalex.org/works/doi:{DOI} 或 https://api.openalex.org/works?search={title} 用於發現和交叉檢查。OpenAlex 彙總其他來源，因此需根據註冊或出版商記錄確認其線索。
• 檢查更正、撤銷和撤回，例如通過 Crossref 更新元數據、出版商通知、PubMed 撤回標誌或 arXiv 版本歷史。
• 使用學術搜尋引擎、作者頁面和次要引用來發現線索或佐證記錄。標明僅有次要證據；不要將其提升為權威確認。
• 通過來源的來源和作品的版本歷史來解決衝突，而不是對複製的元數據進行多數決。說明未解決的衝突。
• 如果可存取的權威記錄提供了匹配的元數據，付費牆限制全文並不阻止存在性檢查。相反地，登入牆、機器人封鎖、速率限制、工具不可用或網路錯誤是存取限制，而非負面證據。嘗試其他允許的來源，並識別哪些內容仍未經檢查。
• 不要向外部審計服務請求或傳輸未發表的手稿段落、私人註釋或整個私人參考文獻列表。僅使用定位所謂公開作品所需的書目欄位。如果條目本身是機密或未發表的，使用可用的本地證據，或在將其外部傳輸前詢問。

指定基於證據的結果

每個輸入出現使用一個主要狀態。即使檢查成功，也要描述已驗證的欄位和剩餘的限制。

狀態	意義
已驗證匹配	已打開的權威記錄確立了同一作品，且提供的承載身份的元數據匹配。識別記錄未暴露的任何提供欄位；不要稱這些欄位為已驗證。
部分匹配 / 元數據不符	可能存在或已確立的作品，但提供的實質欄位衝突，身份或版本仍不明確，或僅有次要證據可用。具體說明適用的情況和需要檢查的欄位。
未驗證	可用證據不足以確立被引用的作品。給出原因：在所執行的搜尋中未找到匹配記錄、存取被封鎖、元數據不足、提取不確定或尚未檢查。
與提供資訊矛盾	正向證據顯示提供的身份是錯誤的，例如標識符解析到不同的作品，且未確立預期的匹配。引用該證據，並將結論限制在被矛盾的聲明。這不是證明沒有預期作品存在。

除了主要狀態之外，附加任何適用的旗標：撤回 (retracted)、撤銷 (withdrawn)、更正 (corrected)（存在勘誤或更正）、被取代 (superseded)（存在後續版本，例如預印本的期刊擴展版）或 關切聲明 (expression of concern)。連結確立每個旗標的通知或記錄。即使對於已驗證匹配的條目，也會報告旗標，因為撤回的作品仍然可以被準確引用。

• 將作品的存在與其引用的準確性分開。一個年份或 DOI 錯誤的真實作品不自動等同於虛構作品。
• 區分未找到證據和反對特定聲明的證據。返回無結果的搜尋、返回 404 的 DOI 或從一個索引中缺席，永遠不證明作品不存在。如果權威來源明確確立不存在或無效，引用或準確總結其狹窄的發現並連結；不要超出其範圍進行推廣。
• 避免僅基於失敗的搜尋使用“假”、“偽造”或“幻覺”等不合格標籤。寧可使用具體問題和上述狀態。
• 僅驗證存在性和書目身份。不要聲稱已閱讀全文、評估研究品質，或檢查其是否支持手稿論點，除非該項單獨的工作已被請求和執行。

交付 Markdown 審計報告

以使用者要求的語言撰寫。保留原始標題、姓名、ID 和標識符。當需要獨立報告或完整審計內容過長不適合聊天時，產出 Markdown 檔案；不要為了縮短摘要而省略條目。除非使用者另有指定，將檔案命名為 reference-audit-YYYY-MM-DD.md（使用審計日期），並保存在主要輸入檔案旁，不覆蓋現有檔案；改為附加後綴如 -2。

從以下內容開始：

• 範圍和來源檔案，包括審計是否涵蓋手稿參考文獻、所有資料庫條目或明確請求的子集。
• 審計日期、提取限制，以及按狀態計數的彙總（總和等於範圍內的輸入出現次數），加上按旗標的計數。
• 盤點結果，例如參考文獻列表中缺失的引用金鑰，以及從未被引用的參考文獻條目。
• 一個簡短的列表，列出最重要的差異和未解決的項目，不要將未解決的條目視為已證明的偽造。

然後包含範圍內的每一個輸入出現，按照原始順序，每個條目一個章節，如下例所示。包括：

1. 原始 ID 和引用： 保留原始措辭或 BibTeX 欄位，若有輸入位置則包含。對於衝突，包含單獨的審計 ID。
2. 狀態、旗標和發現： 說明作品是否已確立，列出任何旗標，並識別確切的元數據差異或歧義。
3. 直接驗證連結： 使用描述性 Markdown 連結指向特定的已打開出版商、DOI、索引、存檔或目錄記錄。識別每個連結的來源及其證實的內容。寧可使用一兩個強大的記錄連結，而非許多冗餘連結。
4. 證據和覆蓋範圍： 說明檢查了哪些內容，哪些欄位匹配或衝突，以及哪些欄位、來源或全文未經檢查。對於未解決的條目，簡要列出嘗試過的有用搜尋或來源，以及遇到的存取限制。
5. 人類下一步： 僅在必要時給出具體行動，例如檢查候選版本、提供缺失的標題或確認預期的 DOI。將任何建議的更正引用標記為建議，並附上其支持來源。

範例結構，其中括號內文字為待替換的佔位符：

### [審計 ID] — [原始引用金鑰或號碼]
- 原始引用：[逐字引用或原始欄位]
- 狀態：[一個主要狀態]
- 旗標：[撤回 / 撤銷 / 更正 / 被取代 / 關切聲明，附上連結的通知；或 "未發現"]
- 發現：[身份結果和具體差異]
- 驗證：[出版商記錄](verified-record-URL)；[註冊機構記錄](verified-registry-URL)
- 已檢查：[來源、匹配/衝突欄位和日期]
- 未檢查 / 限制：[不可用的元數據、全文範圍或存取限制]
- 下一步：[僅在必要時]

僅填入查詢實際返回或通過開啟驗證的 URL。可以從觀察到的 DOI 形成規範的 DOI URL，但在解析和檢查之前標記為未驗證。不要發明 DOI、記錄 URL、元數據、引用或引用文字。可以將搜尋結果連結作為明確標記的搜尋輔助提供；它不是已驗證的記錄連結。如果沒有驗證到記錄連結，請直接說明，而不是留下誤導的連結。

最後，將盤點清單與報告進行比對：沒有遺漏的條目、遺失的原始 ID、意外的重複刪除或未報告的未檢查項目。如果僅完成了請求的完整審計的一部分，將報告標記為部分，並將每個剩餘條目列出為尚未檢查。