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JianYang-Lab/SMR

Ensina agentes de IA a trabalhar de forma eficaz com o código-fonte C++ do SMR (Randomização Mendeliana baseada em Dados Resumidos). Aborda arquitetura, formatos de dados, sistema de compilação, métodos estatísticos e armadilhas comuns.

O que é SMR?

Esta skill é projetada para habilitar agentes de IA de codificação, como Claude Code, Cursor e Codex, a navegar e modificar com proficiência o código-fonte C++ do SMR (Summary-data-based Mendelian Randomization). O SMR é uma ferramenta bioinformática amplamente utilizada para inferir relações causais entre fenótipos usando dados resumidos de GWAS (Estudos de Associação do Genoma Completo) e eQTL (Loci de Características Quantitativas de Expressão). A skill detalha a arquitetura modular do código, os formatos de dados binários e de texto (como arquivos .besd, .epi, .ma e .sum), as nuances do sistema de compilação com Makefile, e os principais métodos estatísticos implementados, como HEIDI (Heterogeneity in Instruments) e análise multivariada. Além disso, destaca armadilhas comuns, como o tratamento de múltiplas variantes instrumentais, o alinhamento de alelos e a necessidade de conjuntos de dados de referência LD (Linkage Disequilibrium).

Funciona com~Claude Code~Codex CLI~Cursor
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Documentação

O que SMR faz?

Ensina agentes de IA de codificação a trabalhar de forma eficaz com o código-fonte C++ do SMR (Randomização Mendeliana baseada em Dados Resumidos). Aborda arquitetura, formatos de dados, sistema de compilação, métodos estatísticos e armadilhas comuns.

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