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zja2004/snv-judge-skill

ミスセンスバリアント病原性予測のための自己完結型エージェントスキル(XGBoost+LightGBM+Isotonicアンサンブル、AUROC 0.9679)。訓練済みモデルを同梱し、ACMG臨床レポート生成をサポートします。

snv-judge-skill とは?

このスキルは、ミスセンスバリアントの病原性を高精度で予測するアンサンブルモデル(SNV-judge v5)をパッケージ化した、自己完結型のAIエージェントスキルです。XGBoost、LightGBM、Isotonic回帰を組み合わせたアンサンブル学習により、AUROC 0.9679という高い識別性能を達成しています。スキルはClaude Code(SKILL.md)およびopencodeサブエージェント定義を同梱しており、エージェンティックワークフローに容易に統合できます。また、DeepSeek、Moonshot、Qwen、OpenAIなど、OpenAI互換の任意のLLMをバックエンドとして利用し、ACMGガイドラインに準拠した臨床レポートを生成することが可能です。これにより、研究者や臨床医は、高性能な病原性予測と自動化されたレポート作成を、一貫したワークフローで実現できます。

対応✓Claude Code✓Codex CLI~Cursor✓OpenCode
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ドキュメント

snv-judge-skill は何をしますか?

自己完結型エージェントスキルで、SNV-judge v5ミスセンスバリアント病原性アンサンブル(XGBoost+LightGBM+Isotonic、AUROC 0.9679)をパッケージ化しています。訓練済みモデルをバンドルし、SKILL.md(Claude Code)とopencodeサブエージェント定義を公開しており、ACMG臨床レポート生成のためにOpenAI互換の任意のLLM(DeepSeek/Moonshot/Qwen/OpenAI)をサポートします。

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