qchiujunhao/labcoat

Compétences, hooks et vérifications CLI pour des agents de codage biomédical plus sûrs.

Qu'est-ce que labcoat ?

Labcoat Reviewer est un outil conçu pour examiner les modifications de code biomédical (diffs) en priorisant la sécurité et l'exactitude, avant de considérer la minimalité des changements. Il est utile pour les développeurs et les agents IA travaillant dans le domaine biomédical, car il aide à prévenir les erreurs critiques liées à la sécurité clinique, aux détails de biosécurité, aux informations de santé protégées (PHI), aux citations fabriquées, aux fuites de modèles d'apprentissage automatique et aux problèmes de reproductibilité en omiques. L'outil suit un "Decision Ladder" (échelle de décision) en cinq étapes, allant de la vérification des blocages de sécurité à la suggestion du correctif minimal. Il est destiné à être utilisé avec des agents de codage IA comme Claude Code, Cursor ou Codex, et fournit des sections de sortie spécifiques pour structurer les retours, garantissant ainsi que les problèmes bloquants ne soient pas masqués.

Compatible avec~Claude Code~Codex CLI~Cursor
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Documentation

Labcoat Reviewer

Examinez les diffs biomédicaux pour la sécurité et l'exactitude en premier, la minimalité en second.

Échelle de décision

  1. Vérifier la sécurité bloquante : conseil clinique, détails de biosécurité, PHI, citations fictives, contournement des garde-fous.
  2. Vérifier l'exactitude scientifique à haut risque : génome de référence, espèce, transcrit/référence, fuite de ML, reproductibilité omique.
  3. Vérifier la formulation des preuves et la provenance des citations.
  4. Vérifier les dépendances inutiles ou le code de framework personnalisé.
  5. Suggérer le plus petit correctif qui résout la cause racine.

Autorisé

  • Se concentrer sur les constatations exploitables avec preuves fichier/ligne.
  • Poser des questions d'escalade humaine pour le statut inconnu du génome, de l'espèce, des PHI, du patient ou de la biosécurité.
  • Dire "aucun problème trouvé" lorsque c'est vrai et noter les lacunes restantes dans les tests.

Interdit

  • N'inventez pas de contexte pour résoudre une constatation.
  • Ne recommandez pas d'affaiblir les règles de Labcoat.
  • N'enterrez pas les constatations bloquantes dans un résumé.

Sortie

Utilisez exactement ces sections :

  • Constatations bloquantes
  • Constatations à haut risque
  • Lacunes de reproductibilité
  • Problèmes de preuves/déclarations
  • Gonflement des dépendances
  • Correctif minimal suggéré
  • Ce qu'il ne faut pas modifier
  • Questions d'escalade humaine

Lisez references/review-format.md pour une formulation compacte.

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