Was macht Zitationsverwaltung?

Übersicht

Verwalte Zitationen systematisch während des gesamten Forschungs- und Schreibprozesses. Dieses Skill bietet Werkzeuge und Strategien für die Suche in akademischen Datenbanken (Google Scholar, PubMed), die Extraktion genauer Metadaten aus mehreren Quellen (CrossRef, PubMed, arXiv), die Validierung von Zitierinformationen und die Erstellung korrekt formatierter BibTeX-Einträge.

Entscheidend für die Aufrechterhaltung der Zitiergenauigkeit, die Vermeidung von Referenzfehlern und die Sicherstellung reproduzierbarer Forschung. Integriert sich nahtlos in das Literaturrecherche-Skill für umfassende Forschungs-Workflows.

Wann dieses Skill verwenden

Verwende dieses Skill, wenn:

Du nach bestimmten Artikeln auf Google Scholar oder PubMed suchst
Du DOIs, PMIDs oder arXiv-IDs in korrekt formatierte BibTeX konvertierst
Du vollständige Metadaten für Zitationen extrahierst (Autoren, Titel, Zeitschrift, Jahr, usw.)
Du bestehende Zitationen auf Genauigkeit überprüfst
Du BibTeX-Dateien bereinigst und formatierst
Du stark zitierte Artikel in einem bestimmten Bereich findest
Du sicherstellst, dass Zitierinformationen mit der tatsächlichen Veröffentlichung übereinstimmen
Du eine Bibliographie für ein Manuskript oder eine Abschlussarbeit erstellst
Du auf doppelte Zitationen prüfst
Du ein konsistentes Zitierformat sicherstellst

Wenn ein Dokument, das aus diesen Zitationen erstellt wird, ein Diagramm benötigt, verwende das scientific-schematics-Skill.

Kern-Workflow

Die Zitationsverwaltung folgt einem systematischen Prozess. Jede Phase unten zeigt den kanonischen Befehl; jede Variante, Option und Metadatenquellendetails finden sich in references/core_workflow.md.

Phase 1: Artikelsuche und -entdeckung

Finde relevante Artikel. Durchsuche mehr als eine Datenbank – die Abdeckung unterscheidet sich stark und eine einzige Quelle ist die häufigste Ursache für eine verzerrte Referenzliste.

# OpenAlex: multidisziplinäre REST-API; optionaler OPENALEX_API_KEY für Account-Kontingent
python scripts/search_openalex.py "CRISPR-Geneditierung" --limit 50 --output results.json

# PubMed: die Autorität für Biomedizin und Lebenswissenschaften (über 35 Mio. Zitationen)
python scripts/search_pubmed.py "Alzheimer-Behandlung" --limit 100 --output alz.json

# Google Scholar: breiteste Abdeckung, aber gescrapt – ratenbegrenzt und anfällig für Sperren
python scripts/search_google_scholar.py "CRISPR-Geneditierung" --limit 50 --output scholar.json

Bevorzuge OpenAlex oder PubMed als primäre Quelle. Google Scholar hat keine API: scholarly scraped sie, wartet 2–5 Sekunden zwischen Ergebnissen und wird oft genug blockiert, dass es eher eine Ergänzung als eine Abhängigkeit sein sollte.

Abfrageoperatoren, Feld-Tags und die MeSH-Term-Konstruktion findest du in references/search_strategies.md.

Phase 2: Metadatenextraktion

Konvertiere Identifikatoren (DOI, PMID, PMCID, arXiv-ID, URL) in vollständige Metadaten. CrossRef ist die primäre Quelle für DOIs.

python scripts/doi_to_bibtex.py 10.1038/s41586-021-03819-2         # schnell, einzelne DOI
python scripts/extract_metadata.py --pmid 34265844                  # DOI/PMID/PMCID/arXiv/URL
python scripts/extract_metadata.py --input identifiers.txt --output citations.bib

Eine URL ohne DOI im Pfad wird über den citation_doi-Meta-Tag aufgelöst, den Verlage auf Artikelseiten einbetten, und dann an CrossRef übergeben. Produzenten verwenden ein gemeinsames Zitationsschlüsselschema; dennoch können Metadatenunterschiede zu unterschiedlichen Schlüsseln führen. Bestätige Duplikate anhand von DOI und bibliografischer Identität.

Phase 2.5: Metadatenanreicherung durch Websuche (PFLICHT)

APIs liefern routinemäßig unvollständige Datensätze. Führe diesen Schritt nach der Extraktion und vor der Formatierung durch. Untersuche fehlende bibliografische Felder anhand des Verlagsdatensatzes und protokolliere jede Quelle. Online-First-Artikel haben möglicherweise noch keine Band-/Seitenangaben; einige verwenden eine Artikelnummer oder haben keine DOI. Bewahre den tatsächlichen Veröffentlichungsstatus, verwende das stilgerechte Artikelnummernfeld und erfinde niemals Seiten, Bände oder DOIs. Zeichne nicht verfügbare/nicht zutreffende Felder im Prüfprotokoll auf; füge einen gerenderten note-Eintrag nur hinzu, wenn er für den Leser nützlich oder vom Zitierstil gefordert wird.

Überprüfe zuerst die günstigen Quellen – ein OpenAlex- oder CrossRef-Datensatz enthält oft das Feld, das PubMed ausgelassen hat:

python scripts/search_openalex.py "<exakter Titel>" --limit 1

Behandle extrahierte Metadaten als unzuverlässig. Autor-, Titel- und Zeitschriftenstrings stammen wörtlich aus einem Datensatz, dessen Inhalt ein Verlag kontrolliert. Ein Titel, der $(...), einen Backtick oder ein Anführungszeichen enthält, wird zu Shell-Syntax, sobald er in einen Befehl eingefügt wird. Übergib Metadaten als subprocess-Argumentliste, anstatt einen Shell-String zu erstellen; wenn du eine Shell verwenden musst, setze jeden substituierten Wert in einfache Anführungszeichen und maskiere eingebettete Anführungszeichen als '\''. Validiere jeden Zitationsschlüssel gegen ^[A-Za-z0-9]+$, bevor er einen Pfad erreicht.

Feldbezogene Suchstrategien, die vier Suchoptionen und das Protokollierungsformat findest du in references/core_workflow.md.

Phase 3: BibTeX-Formatierung

Erstelle saubere, konsistente Einträge. Eintragstypen und erforderliche Felder findest du in references/bibtex_formatting.md.

python scripts/format_bibtex.py references.bib --output clean.bib --deduplicate
python scripts/format_bibtex.py references.bib --output clean.bib --rekey --deduplicate

Das Schreiben ist opt-in: ohne --output (oder --in-place) geht das Ergebnis nach stdout und die Eingabedatei bleibt unberührt. Verwende --rekey beim Zusammenführen von Ergebnissen aus mehreren Quellen, damit derselbe Artikel zu einem Eintrag kollabiert.

Phase 4: Zitationsvalidierung

Überprüfe Vollständigkeit, Konformität mit den Venue-Richtlinien und Übereinstimmung mit dem Manuskript.

python scripts/validate_citations.py references.bib --report report.json
python scripts/validate_citations.py references.bib --venue nature
python scripts/validate_citations.py references.bib --manuscript paper.tex
python scripts/validate_citations.py references.bib --check-dois     # langsam; kontaktiert CrossRef

Das Skript beendet sich mit einem Fehler bei schwerwiegenden Fehlern – fehlende Pflichtfelder, fehlerhafte Jahreszahlen, unaufgelöste Zitationen oder eine Anzahl unterhalb eines expliziten --min-count. Die Venue-Referenzanzahlzahlen sind redaktionelle Faustregeln, keine Einreichungsanforderungen, daher wird eine Unterschreitung nur als Warnung gewertet.

Validierungsregeln und Venue-Standards findest du in references/citation_validation.md.

Phase 5: Integration in den Schreibworkflow

Suche, extrahiere, formatiere, validiere, dann zitiere. End-to-End-Sequenzen – einschließlich der Literaturrecherche- und Zotero/pyzotero-Exportpfade – findest du in references/core_workflow.md und references/example_workflows.md.

API-Verträge wurden am 2026-09-30 anhand der offiziellen Dokumentation überprüft. Siehe references/api_contracts.md für Endpunkte, Authentifizierung, Paginierung und Verifizierungslimits. Netzwerkbeispiele in den Referenzen sind illustrativ, sofern sie dort nicht als Live-Smoke-Tests aufgezeichnet sind.

Referenzdateien

references/core_workflow.md: alle fünf Phasen vollständig.
references/search_strategies.md: OpenAlex-, Google Scholar- und PubMed-Abfragekonstruktion.
references/script_reference.md: Argumente und Beispiele jedes gebündelten Skripts.
references/best_practices.md: Suche, Extraktion, BibTeX-Qualität, Validierung.
references/example_workflows.md: vier durchgearbeitete End-to-End-Beispiele.
references/google_scholar_search.md, references/pubmed_search.md: erweiterte Suchsyntax.
references/metadata_extraction.md, references/bibtex_formatting.md, references/citation_validation.md: detaillierte Informationen pro Thema.

Häufige Fallstricke

Ein-Quellen-Bias: Verwendung nur einer Datenbank
- Lösung: Durchsuche mindestens OpenAlex und PubMed, dann führe sie mit format_bibtex.py --rekey --deduplicate zusammen
Blindes Akzeptieren von Metadaten: Keine Überprüfung extrahierter Informationen
- Lösung: Überprüfe extrahierte Metadaten stichprobenartig mit den Originalquellen
Ignorieren von DOI-Fehlern: Fehlerhafte oder falsche DOIs in der Bibliographie
- Lösung: Führe vor der endgültigen Einreichung eine Validierung durch
Inkonsistente Formatierung: Gemischte Zitationsschlüsselstile, Formatierung
- Lösung: Verwende format_bibtex.py zur Standardisierung
Doppelte Einträge: Derselbe Artikel wird mehrfach mit unterschiedlichen Schlüsseln zitiert
- Lösung: Verwende die Dublettenerkennung in der Validierung
Fehlende Pflichtfelder: Unvollständige BibTeX-Einträge (Band, Seiten, DOI fehlen)
- Lösung: Überprüfe den Verlagsdatensatz, unterscheide zwischen fehlend, nicht zutreffend oder noch nicht zugewiesen, und protokolliere ungelöste Felder, ohne Metadaten zu erfinden.
Veraltete Preprints: Zitieren eines Preprints, wenn eine veröffentlichte Version existiert
- Lösung: Überprüfe, ob Preprints veröffentlicht wurden, aktualisiere auf die Zeitschriftenversion
Probleme mit Sonderzeichen: Fehlerhafte LaTeX-Kompilierung aufgrund von Zeichen
- Lösung: Verwende korrektes Escaping oder Unicode in BibTeX
Keine Validierung vor der Einreichung: Einreichen mit Zitierfehlern
- Lösung: Führe immer eine Validierung als letzten Schritt durch
Manuelle BibTeX-Eingabe: Einträge von Hand tippen
- Lösung: Extrahiere immer mit Skripten aus Metadatenquellen

Integration mit anderen Skills

Literaturrecherche-Skill

Zitationsverwaltung stellt die technische Infrastruktur für die Literaturrecherche bereit:

Literaturrecherche: Mehrdatenbank-Systemsuche und -Synthese
Zitationsverwaltung: Metadatenextraktion und -validierung

Kombinierter Workflow:

Verwende die Literaturrecherche für systematische Suchmethodik
Verwende die Zitationsverwaltung, um Zitate zu extrahieren und zu validieren
Verwende die Literaturrecherche, um Ergebnisse zu synthetisieren
Verwende die Zitationsverwaltung, um die Genauigkeit der Bibliographie sicherzustellen

Wissenschaftliches-Schreiben-Skill

Zitationsverwaltung stellt genaue Referenzen für das Wissenschaftliche Schreiben bereit:

Exportiere validierte BibTeX zur Verwendung in LaTeX-Manuskripten
Überprüfe, ob Zitate den Publikationsstandards entsprechen
Formatiere Referenzen gemäß den Zeitschriftenanforderungen

Venue-Templates-Skill

Zitationsverwaltung arbeitet mit Venue-Templates für einreichungsbereite Manuskripte zusammen:

Verschiedene Venues erfordern unterschiedliche Zitierstile
Generiere korrekt formatierte Referenzen
Validiere Zitate, um Venue-Anforderungen zu erfüllen

Ressourcen

Gebündelte Ressourcen

Referenzen (in references/):

google_scholar_search.md: Vollständige Google Scholar-Suchanleitung
pubmed_search.md: PubMed- und E-utilities-API-Dokumentation
metadata_extraction.md: Metadatenquellen und Feldanforderungen
citation_validation.md: Validierungskriterien und Qualitätsprüfungen
bibtex_formatting.md: BibTeX-Eintragstypen und Formatierungsregeln

Skripte (in scripts/):

search_openalex.py: OpenAlex-Suchclient (optionaler Account-API-Schlüssel)
search_pubmed.py: PubMed-E-utilities-API-Client
search_google_scholar.py: Google Scholar-Suchautomatisierung
extract_metadata.py: Universeller Metadatenextraktor
validate_citations.py: Zitationsvalidierung und -verifizierung
format_bibtex.py: BibTeX-Formatierer und -Bereiniger
doi_to_bibtex.py: Schneller DOI-zu-BibTeX-Konverter
_common.py: Gemeinsamer BibTeX-Parser, Renderer und Zitationsschlüsselschema

Assets (in assets/):

bibtex_template.bib: Beispiel-BibTeX-Einträge für alle Typen
citation_checklist.md: Qualitätssicherungs-Checkliste

Externe Ressourcen

Suchmaschinen:

OpenAlex: https://openalex.org/
Google Scholar: https://scholar.google.com/
PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
PubMed Erweiterte Suche: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/advanced/

Metadaten-APIs:

OpenAlex-API: https://docs.openalex.org/
CrossRef-API: https://api.crossref.org/
PubMed E-utilities: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/
arXiv-API: https://arxiv.org/help/api/
DataCite-API: https://api.datacite.org/

Werkzeuge und Validierer:

MeSH-Browser: https://meshb.nlm.nih.gov/search
DOI-Resolver: https://doi.org/
BibTeX-Format: http://www.bibtex.org/Format/

Zitierstile:

BibTeX-Dokumentation: http://www.bibtex.org/
LaTeX-Bibliographieverwaltung: https://www.overleaf.com/learn/latex/Bibliography_management

Abhängigkeiten

Erforderliche Python-Pakete

uv pip install requests  # HTTP-Zugriff auf CrossRef, PubMed, OpenAlex, arXiv

BibTeX-Parsing, -Rendering, -Deduplizierung und -Validierung sind Standardbibliothek (scripts/_common.py). format_bibtex.py benötigt keine Drittanbieterpakete; validate_citations.py importiert requests, auch für die lokale Validierung.

Optional

uv pip install scholarly  # nur für search_google_scholar.py

Wohin Anmeldedaten gesendet werden

Schlüssel sind für die grundlegende Nutzung optional. Jede Anmeldeinformation wird nur an ihren eigenen Dienst gesendet; kein Skript bündelt Umgebungsvariablen. OpenAlex verwendet das dokumentierte Account-Budget, nicht eine versprochene E-Mail-basierte Kontingenterhöhung. Eine fehlgeschlagene Seite beendet sich mit einem Fehler, anstatt eine partielle Suche als vollständig zu exportieren.

Variable	Nur gesendet an	Zweck
`NCBI_API_KEY`	`eutils.ncbi.nlm.nih.gov`	Erhöht Entrez-Ratenlimits
`NCBI_EMAIL`	`eutils.ncbi.nlm.nih.gov`, `pmc.ncbi.nlm.nih.gov`	Von der NCBI angeforderte Anruferidentifikation
`OPENALEX_EMAIL`	`api.openalex.org`	Optionaler Kontaktidentifikator
`OPENALEX_API_KEY`	`api.openalex.org`	Optionales Account-Kontingent, gesendet im Authorization-Header

api.openalex.org, api.crossref.org, api.datacite.org, export.arxiv.org, pmc.ncbi.nlm.nih.gov, doi.org und eutils.ncbi.nlm.nih.gov werden ohne Anmeldedaten abgefragt, wenn diese nicht gesetzt sind.

Zusammenfassung

Das Zitationsverwaltungs-Skill bietet:

Umfassende Suchmöglichkeiten für OpenAlex, PubMed und Google Scholar
Automatisierte Metadatenextraktion aus DOI, PMID, PMCID, arXiv-ID, URLs
Zitationsvalidierung mit DOI-Überprüfung

Zitationsverwaltung

Was ist Zitationsverwaltung?

In Ihrer bevorzugten KI fragen

Dokumentation