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Zhubiao112/habilidade-de-estatística-e-interpretação-de-microbioma

Habilidade Codex para estatísticas downstream de microbioma, escolha de modelo e interpretação de resultados.

Descrição

Esta habilidade fornece ao Codex a capacidade de guiar usuários através de análises estatísticas de dados de microbioma, desde a seleção do modelo adequado até a interpretação dos resultados. Ela suporta testes de hipóteses comuns, ajuste de modelos lineares e análise de composição.

Como usar

1. Certifique-se de que o Codex esteja ativo no seu terminal.
2. Invoque a habilidade diretamente com um prompt relacionado a estatísticas de microbioma.
3. Exemplo: "Realize análise de abundância diferencial usando DESeq2 nos dados fornecidos."

Funcionalidades

• Seleção de modelo: Recomenda o melhor modelo estatístico com base no tipo de dado (contagem, proporção, etc.).
• Análise estatística: Executa DESeq2, ANCOM-BC, ALDEx2, e testes de permutação.
• Interpretação: Fornece explicações claras sobre os resultados, incluindo significância estatística e relevância biológica.
• Visualização: Gera gráficos como volcano plots, heatmaps e boxplots diretamente no terminal.

Suporte a plataformas

• Codex

Notas

• Os dados devem estar em formato de tabela de contagem (OTU/ASV) ou abundância relativa.
• Certifique-se de que as bibliotecas R/Python necessárias estejam instaladas no ambiente.

Licença

MIT