WangPochard/FHIR_NGS

Implementa NGS (Sequenciamento de Nova Geração) com Claude code SKILL & SubAgent.

O que é FHIR_NGS?

Esta skill implementa o processo de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) para dados genômicos, utilizando o padrão FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) e integrando-se ao Claude Code como SKILL e SubAgent. Ela permite que desenvolvedores e pesquisadores lidem com dados de sequenciamento genético (como arquivos FASTQ, BAM, VCF) e os convertam para recursos FHIR padronizados, facilitando a interoperabilidade com sistemas de saúde. A skill é útil para automatizar pipelines de bioinformática, análise de variantes e geração de relatórios clínicos baseados em NGS. Ela suporta Claude Code e agentes similares, oferecendo comandos para submissão de jobs, consulta de resultados e integração com ferramentas como BWA, GATK e bcftools. Ao usar SubAgents, a skill pode delegar tarefas específicas (como alinhamento ou chamada de variantes) a subprocessos especializados, otimizando o fluxo de trabalho.

Funciona com✓Claude Code~Codex CLI~Cursor
npx skills add WangPochard/FHIR_NGS

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Documentação

O que FHIR_NGS faz?

Implementa NGS (Sequenciamento de Nova Geração) com Claude code SKILL & SubAgent.

Fonte: https://github.com/WangPochard/FHIR_NGS

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