FidhaNazreen/MDSimulationAgent

CLI Python instalável que orquestra um fluxo de trabalho completo de Dinâmica Molecular (MD) com GROMACS, a partir de um prompt em linguagem natural via Claude Code — DAG de 13 etapas, fingerprinting por etapa, retomada após falha, 3 skills do Claude, 8 tutoriais e mais de 148 testes.

O que é MDSimulationAgent?

Este agente é uma ferramenta de linha de comando (CLI) em Python, instalável, que automatiza todo o pipeline de simulação de Dinâmica Molecular (MD) usando o software GROMACS, a partir de uma descrição em linguagem natural. Ele implementa um grafo acíclico dirigido (DAG) com 13 etapas bem definidas, cada uma com fingerprinting específico para garantir a rastreabilidade e a capacidade de retomada após uma falha ou interrupção. O agente foi projetado para ser acionado via Claude Code, oferecendo três skills especializadas (skill principal, skill de força bruta e skill de inspetor de resultados) que integram-se perfeitamente ao ecossistema do Claude. Além disso, o projeto inclui oito tutoriais completos e uma suíte robusta de mais de 148 testes automatizados, garantindo confiabilidade e facilitando a adoção por pesquisadores e engenheiros que desejam executar simulações complexas de MD sem necessidade de intervenção manual constante.

Funciona com✓Claude Code~Codex CLI~Cursor
npx skills add FidhaNazreen/MDSimulationAgent

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Documentação

O que MDSimulationAgent faz?

CLI Python instalável que orquestra um fluxo de trabalho completo de Dinâmica Molecular (MD) com GROMACS, a partir de um prompt em linguagem natural via Claude Code — DAG de 13 etapas, fingerprinting por etapa, retomada após falha, 3 skills do Claude, 8 tutoriais e mais de 148 testes.

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