mqqq333/cortex-visualization-skill

cortex-visualization-skill은(는) 무엇을 하나요?

Python/R 이중 백엔드, ggseg 기반 폴리곤 에셋, 피질하 스타일 SVG/PDF 출력을 사용하는 재현 가능한 2D 피질 지도 시각화를 위한 Codex 스킬입니다.

개요

이 스킬은 신경과학 연구를 위해 재현 가능한 2D 피질 지도 시각화를 생성합니다. 다음을 지원합니다:

• Python 백엔드: cortexvis 패키지 사용
• R 백엔드: ggseg 패키지 사용
• 출력 형식: SVG, PDF
• 에셋: ggseg에서 파생된 미리 생성된 폴리곤 에셋

설치

Python 백엔드

pip install cortexvis

R 백엔드

install.packages("ggseg")
install.packages("ggplot2")

사용법

Python 예제

from cortexvis import plot_cortical_map

# 폴리곤 에셋 로드
assets = load_ggseg_assets("desterieux")

# 피질 지도 생성
fig = plot_cortical_map(
    data=my_data,
    assets=assets,
    region_column="region",
    value_column="value"
)

# SVG로 저장
fig.save("cortical_map.svg", format="svg")

R 예제

library(ggseg)
library(ggplot2)

# 데이터 로드
my_data <- data.frame(
    region = c("precentral", "postcentral"),
    value = c(0.5, 0.8)
)

# 피질 지도 그리기
ggplot(my_data) +
    geom_brain(
        atlas = dk,
        aes(fill = value),
        position = position_brain(hemi ~ side)
    ) +
    scale_fill_viridis_c()

# PDF로 저장
ggsave("cortical_map.pdf", device = "pdf")

에셋

사전 생성된 폴리곤 에셋은 다음 디렉터리에서 사용할 수 있습니다:

assets/
├── desterieux/
│   ├── left_hemisphere.json
│   └── right_hemisphere.json
├── dk/
│   ├── left_hemisphere.json
│   └── right_hemisphere.json
└── aseg/
    └── subcortical.json

출력 형식

• SVG: 웹 및 편집 가능한 벡터 그래픽에 적합합니다.
• PDF: 간행물 준비가 완료된 고품질 출력에 적합합니다.

라이선스

이 스킬은 MIT 라이선스에 따라 제공됩니다. 자세한 내용은 LICENSE 파일을 참조하십시오.