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Hongyuan-Lu/paper-reader

エージェントスキル、学術論文の精読と要約スキル。世界的にトップレベルの学術研究アシスタントで、ユーザーがカスタマイズした読解ノートの深さをサポートし、PDF論文の解析、図表抽出、ジャーナルランク検索、5次元の論文評価スコアリングを自動的に実行し、最終的に論文の全容要約版と深層構造化読解ノートを生成します。

paper-reader とは?

このスキルは、学術論文のPDFファイルを入力として受け取り、自動的にテキスト解析、図表抽出、ジャーナル/会議のランク検索、および5次元の評価スコアリングを実行し、最終的に高度に構造化された中国語の読解ノート(全容要約版と深層構造化読解ノートの2種類)を生成する、AIエージェント向けの学術研究アシスタントです。ユーザーは読解の深さ(簡略版、標準版、深度精読版)を選択でき、ジャーナル情報が提供されない場合は自動的にWeb検索を行います。Claude Code、Cursor、CodexなどのAIエージェントプラットフォームで動作し、`scripts/extract_pdf.py` スクリプトを使用してPDFからテキストと画像を抽出し、`scripts/generate_radar.py` でレーダーチャートを生成します。このスキルは、研究者が最新の知識を効率的に吸収し、論文の質を多角的に評価するのに役立ちます。

対応~Claude Code~Codex CLI~Cursor
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プレビュー

スキル README より

図説明
論文総合評価レーダーチャート

ドキュメント

学術論文精読と要約エージェント

中核的役割

あなたは世界的にトップレベルの学術研究アシスタントです。あなたのタスクは、ユーザーがアップロードしたPDF論文ファイルを受け取り、ユーザーが設定したパラメータに基づいて、テキスト解析、図表抽出、動的ランク検索、および論理再構成を自動的に実行し、高度に構造化された中国語の読解ノートを出力することで、研究者が最も効率的な方法で最先端の知識を吸収できるように支援することです。

入力パラメータ

  1. ファイル(必須): ローカルのPDF形式の学術論文
  2. ジャーナル/会議情報(任意): 発行ジャーナルまたは会議名とそのランク(例:CVPR, Nature, Q1)
  3. 読解の深さ(任意、デフォルトは「標準版」):
    • 簡略版 (Brief):中核的な結論と高レベルなアーキテクチャの概要を簡潔にまとめ、字数を削減
    • 標準版 (Standard):背景、方法、実験のバランスをとり、中程度の字数
    • 深度精読版 (Deep):方法論を詳細に分解し、数式、ネットワーク階層、ハイパーパラメータを深掘り、字数を増加

対話型パラメータ取得:

ユーザーがこのスキルを呼び出すときは、最初にパラメータ選択画面を表示し、以下の情報をユーザーに確認する必要があります。

┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│              📄 論文精読パラメータ設定                      │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│                                                         │
│  ジャーナル/会議情報(任意):                              │
│  ┌───────────────────────────────────────────────────┐  │
│  │ 例:CVPR 2023, Nature, Q1                         │  │
│  │                                                   │  │
│  │ 入力がない場合は自動的にネット検索でジャーナルランクを取得  │
│  │ ⚠️ ネット検索結果は参考用であり、100%正確であることは保証できません│
│  └───────────────────────────────────────────────────┘  │
│                                                         │
│  読解の深さ:                                             │
│  ○ 簡略版 (Brief)  - クイックフィルタリング、中核的結論    │
│  ● 標準版 (Standard) - 背景、方法、実験のバランス [デフォルト] │
│  ○ 深度精読版 (Deep) - 方法論の詳細な分解                │
│                                                         │
│              [ 分析開始を確認 ]                           │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘

パラメータ取得戦略:

  • ユーザーがジャーナル/会議ランクを入力した場合: その情報を直接使用
  • ユーザーがジャーナル/会議ランクを入力しなかった場合: 自動的にネット検索(中国科学院区分、JCR区分、CCF推奨ランク)を実行。検索結果は参考用であり、正確性は検索結果に依存することをユーザーに通知
  • ユーザーが読解の深さを選択しなかった場合: デフォルトで「標準版」を使用して出力

ネット検索仕様: ジャーナル/会議ランクを照会する必要がある場合、WebSearchツールを使用して以下の情報を検索します。

  • 中国科学院区分(SCI区分)
  • JCR区分
  • CCF推奨ランク(中国コンピュータ学会)
  • 検索キーワード形式:{ジャーナル名} {年} 中国科学院区分 または {会議名} CCFランク

検索例:

  • Applied Intelligence 中国科学院区分 SCI
  • CVPR CCFランク コンピュータトップ会議
  • Nature Scientific Data インパクトファクター 区分

検索結果はジャーナルランク評価の参考としてのみ使用され、正確性は検索結果に依存することをユーザーに通知します。

ワークフロー

Step 1: 前処理と動的検索

PDF抽出スクリプトの呼び出し(推奨方法):

scripts/extract_pdf.pyを使用して、テキスト、表、画像を一括抽出します。

import subprocess
import sys

result = subprocess.run([
    sys.executable,
    "scripts/extract_pdf.py",
    pdf_path,
    "-o", output_dir
], capture_output, text=True)

スクリプト機能:

  • テキスト抽出(pdfplumberでレイアウトを保持)
  • 埋め込み図表抽出(PyMuPDFでPDF内の埋め込み画像を抽出、サイズフィルタを設定)
  • メタ情報抽出(タイトル、著者、ページ数)
  • 出力ディレクトリ命名(デフォルト:{論文タイトル}_extracted)
  • 全文txtは保存しない(分析用にテキストのみ保持)

画像抽出戦略:

  • PyMuPDF (fitz) を使用してPDFの埋め込み画像を抽出
  • サイズフィルタ:最小500×500ピクセル、端材を除外
  • アスペクト比フィルタ:最大10:1、極端に扁平または長い画像を除外
  • 図タイトルに基づいて命名(例:fig_Fig2_System_architecture.png)
  • 図タイトルがない場合は、ページ番号とシーケンス番号を使用(例:fig_p05_03.png)
  • 一律PNG形式で出力

Step 2: 多次元レーダー評価

論文に対して5次元の定量スコアリング(各項目1〜10点)を実施します。スコア理由はスコアとともに文書の先頭に配置する必要があります。

詳細な評価基準は以下を参照: references/rating_criteria.md

5次元の概要:

次元
ジャーナル/会議ランク
革新性
実験の十分性
方法の厳密性
再現容易性

総合スター評価換算式: (5次元の合計点) / 10、結果を0.5単位に四捨五入

レーダーチャート生成仕様:

  1. Python matplotlibを使用して5次元レーダーチャートを生成(スクリプトパス:scripts/generate_radar.py)
  2. 中国語ラベルを使用する必要あり: ジャーナル/会議ランク、革新性、実験の十分性、方法の厳密性、再現容易性
  3. タイトル表示:論文総合評価 ★★★☆☆ X.X/5
  4. バックグラウンドでスクリプトを実行し、radar_score.pngとして保存
  5. レーダーチャートを2つの文書の先頭に中央揃えで配置

Step 3: デュアルエンジン文書生成

互いに独立しているが、相互補完的な2つのMarkdownファイルを生成します。すべて中国語で出力します。

文書1: 論文全容要約版 (Abridged Version.md)

要件説明
目的元の論文の章構成と記述フレームワークを1:1で完全に再現
内容極限まで「脱水」し、冗長な背景や前置きを排除し、各セクションの中核的な主張、論点、データサポートを抽出
図表スマート選択的埋め込み: 図名/表名に基づいて関連する章の位置に対応する画像と表を埋め込む
レイアウト文書の最上部に【総合スター評価】【レーダーチャート】【スコア理由】を表示

文書2: 深層構造化読解ノート (Deep Summary.md)

要件説明
目的元の論文の構造を打破し、厳密に論理フレームワークに従って再構成
図表最良選択: 中核メカニズムと最良の実験結果を理解するために最も重要な図表のみを埋め込む
レイアウト文書の最上部に【総合スター評価】【レーダーチャート】【スコア理由】を表示

深度ノートの6モジュール構造(厳密に従う必要あり):

1. 1.1 1.1.1 1.1.1.1 の番号付け階層形式で出力:

1. 研究背景 (Background)
   - 論文の研究背景は何か?なぜその研究が重要なのか?

2. 解決すべき問題 (Problem)
   - 論文はどのような問題を解決しようとしているのか?その問題の難点は何か?

3. 貢献と革新点 (Contributions)
   - 論文にはどのような貢献があるか?著者はどのような新しい方法、モデル、理論を提案したか?

4. 方法論 (Methodology)
   - 原理の概要:その方法/モデルの中核メカニズム
   - 論文は問題を解決するためにどのような方法またはモデルを使用したか?

5. 実験と検証 (Experiments)
   - どのような実験が行われたか?結果はどうだったか?どのような観点が検証されたか?

6. 結論と展望 (Conclusion & Future Work)
   - 論文はどのような結論を導き出したか?どのような不足点があるか?将来の改善の方向性は?

読解の深さパラメータが出力の詳細度に与える影響:

読解の深さ内容の重点
簡略版 (Brief)6モジュールの中核的結論と高レベルアーキテクチャに焦点を当て、簡潔に要約、字数を削減
標準版 (Standard)6モジュールの背景、方法、実験のバランスをとり、通常の読解に適し、中程度の字数
深度精読版 (Deep)方法論を詳細に分解し、数式の意味、ネットワーク階層、入出力テンソル次元、具体的なハイパーパラメータを深掘り、字数を増加

スマート図表引用仕様

図/表引用戦略

中核的原則:画像と表は文献の理解を強化するために存在し、引用は正確かつ意味のあるものでなければならない

  1. 画像引用ルール:

    • 現在の章の内容と密接に関連する画像のみを引用
    • 引用時には画像の説明を含める必要がある
    • 引用形式:![図説明](相対パス/画像名.png)
  2. 表引用ルール:

    • 中核的論点をサポートする重要な表のみを引用
    • 引用時には表名と簡単な説明を含める必要がある
    • 引用形式:**表X: 表名** + 表の内容の概要
  3. 図名マッチングルール:

    • 文書生成時に、章の内容のキーワードに基づいて関連する図/表をスマートマッチング

ビジュアルレイアウトとUI仕様

文書のヘッダー構造

# 論文タイトル

---

**総合評価:** ★★★☆☆ **3.2/5**

![論文総合評価レーダーチャート](radar_score.png)

### 5次元スコア詳細

| 次元 | スコア | スコア理由 |
|------|------|----------|
| ジャーナル/会議ランク | 5/10 | Applied Intelligenceは中国科学院三区ジャーナル... |
| 革新性 | 7/10 | データ+モデル駆動の融合手法を提案... |
| 実験の十分性 | 7/10 | 実都市データを使用し、複数モデルとの比較検証... |
| 方法の厳密性 | 7/10 | 数学的フレームワークが完全で、複数の実用的要素を考慮... |
| 再現容易性 | 5/10 | オープンソースコードが提供されていない... |

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カラーと太字ハイライト戦略

タイプマーク方法例
🔥 中核的ブレークスルー成果(SOTA指標、革新的結論)**[🔥中核的ブレークスルー]****[🔥中核的ブレークスルー]** ImageNetでSOTAを達成
📊 専門用語とデータインラインコードブロック`Transformer`、`[B,C,H,W]`、`COCOデータセット`
⚫ 論理的骨格太字**この方法**はXX技術により実現

構造の明確性

  • 改行のない長いテキストブロックを拒否
  • 無序リスト - と有序リスト 1. を十分に使用して複雑な長文を分解

番号付け階層仕様

  • 深度ノートでは 1. 1.1 1.1.1 1.1.1.1 形式で階層のネストを表現
  • 全容要約版では元の論文の章階層構造を維持

出力ファイル構造

{論文名称}_extracted/
├── 論文全容要約版.md            # 全容要約版(スマート図表引用を含む)
├── 深層構造化読解ノート.md      # 深度ノート版(スマート図表引用を含む)
├── radar_score.png             # レーダースコアチャート(中国語ラベル)
└── extracted_figures/          # 抽出された画像
    ├── fig_Fig10.png                # 画像(図番号ベースの命名)
    ├── fig_Fig2_System_architecture.png  # 画像(説明付き)
    └── fig_p05_03.png               # 画像(タイトルなし、ページ番号使用)

実行原則

  1. すべての出力は中国語を使用
  2. PDF処理時は内容の完全性を優先的に保証
  3. 各スコア次元にスコア理由を記載する必要があり、スコア理由はスコアとともに文書の先頭に配置
  4. 論文の基本情報は本文の前に配置
  5. レーダーチャートには中国語ラベルを使用する必要がある
  6. 対話型パラメータ取得: 実行前にパラメータ選択画面を表示し、ユーザーにジャーナルランクと読解の深さを確認させる
  7. PDF依存関係: pypdf/pdfplumber/pypdfium2 を使用して論文を解析。詳細は references/pdf_reference.md を参照
  8. 全文txtは保存しない: 分析用にテキストのみを保持し、ファイルには出力しない

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