cafferychen777/ChatSpatial

ChatSpatial とは？

ChatSpatialは、空間トランスクリプトミクス（spatial transcriptomics）データの解析を自然言語インターフェースで実現するMCPサーバーです。ユーザーは複雑なプログラミング知識を必要とせず、チャット形式で遺伝子発現パターンの可視化、空間クラスタリング、組織領域間の遺伝子発現比較などの解析を実行できます。主にClaude CodeやCursor、CodexなどのAIエージェントプラットフォームと連携し、MCP（Model Context Protocol）を通じて解析機能を提供します。Pythonベースで構築され、標準的な空間トランスクリプトミクスデータ形式（例：10x Genomics）をサポートし、SeuratやScanpyのような主要解析パイプラインとシームレスに統合できます。これにより、生物学者やバイオインフォマティシャンは、コードを書かずに直感的な対話で高度な空間遺伝子発現解析を行えるようになります。