seqera-automation

Seqera-Automation über Rube MCP

Automatisiere Seqera-Operationen mit dem Composio Seqera-Toolkit über Rube MCP.

Toolkit-Dokumentation: composio.dev/toolkits/seqera

Voraussetzungen

• Rube MCP muss verbunden sein (RUBE_SEARCH_TOOLS verfügbar)
• Aktive Seqera-Verbindung über RUBE_MANAGE_CONNECTIONS mit Toolkit seqera
• Rufe immer zuerst RUBE_SEARCH_TOOLS auf, um die aktuellen Toolschemata zu erhalten

Einrichtung

Rube MCP holen: Füge https://rube.app/mcp als MCP-Server in deiner Client-Konfiguration hinzu. Keine API-Schlüssel nötig – füge einfach den Endpunkt hinzu und es funktioniert.

1. Überprüfe, ob Rube MCP verfügbar ist, indem du bestätigst, dass RUBE_SEARCH_TOOLS antwortet
2. Rufe RUBE_MANAGE_CONNECTIONS mit Toolkit seqera auf
3. Wenn die Verbindung nicht AKTIV ist, folge dem zurückgegebenen Authentifizierungslink, um die Einrichtung abzuschließen
4. Bestätige, dass der Verbindungsstatus AKTIV anzeigt, bevor du Workflows ausführst

Tool-Entdeckung

Entdecke immer verfügbare Tools, bevor du Workflows ausführst:

RUBE_SEARCH_TOOLS
queries: [{use_case: "Seqera-Operationen", known_fields: ""}]
session: {generate_id: true}

Dies gibt verfügbare Tool-Slugs, Eingabeschemata, empfohlene Ausführungspläne und bekannte Fallstricke zurück.

Kernarbeitsablauf-Muster

Schritt 1: Verfügbare Tools entdecken

RUBE_SEARCH_TOOLS
queries: [{use_case: "deine spezifische Seqera-Aufgabe"}]
session: {id: "existierende_sitzungs_id"}

Schritt 2: Verbindung prüfen

RUBE_MANAGE_CONNECTIONS
toolkits: ["seqera"]
session_id: "deine_sitzungs_id"

Schritt 3: Tools ausführen

RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL
tools: [{
  tool_slug: "TOOL_SLUG_AUS_SUCHE",
  arguments: {/* schema-konforme Argumente aus Suchergebnissen */}
}]
memory: {}
session_id: "deine_sitzungs_id"

Bekannte Fallstricke

• Immer zuerst suchen: Toolschemata ändern sich. Hartcodiere niemals Tool-Slugs oder Argumente ohne vorherigen Aufruf von RUBE_SEARCH_TOOLS
• Verbindung prüfen: Stelle sicher, dass RUBE_MANAGE_CONNECTIONS den Status AKTIV anzeigt, bevor du Tools ausführst
• Schema-Konformität: Verwende die genauen Feldnamen und -typen aus den Suchergebnissen
• Memory-Parameter: Füge immer memory in RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL-Aufrufe ein, auch wenn es leer ist ({})
• Sitzungswiederverwendung: Verwende Sitzungs-IDs innerhalb eines Workflows wieder. Generiere neue für neue Workflows
• Seitennummerierung: Überprüfe Antworten auf Seitennummerierungs-Token und setze das Abrufen fort, bis alles vollständig ist

Kurzreferenz

Operation	Ansatz
Tools finden	RUBE_SEARCH_TOOLS mit Seqera-spezifischem Anwendungsfall
Verbinden	RUBE_MANAGE_CONNECTIONS mit Toolkit seqera
Ausführen	RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL mit entdeckten Tool-Slugs
Massenoperationen	RUBE_REMOTE_WORKBENCH mit run_composio_tool()
Vollständiges Schema	RUBE_GET_TOOL_SCHEMAS für Tools mit schemaRef

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